Protein–RNA interactions for Protein: O88940

Msc, Musculin, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MscO88940 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MscO88940 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MscO88940 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MscO88940 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MscO88940 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MscO88940 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MscO88940 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MscO88940 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MscO88940 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MscO88940 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MscO88940 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MscO88940 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MscO88940 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MscO88940 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MscO88940 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MscO88940 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MscO88940 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MscO88940 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MscO88940 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MscO88940 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MscO88940 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MscO88940 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MscO88940 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MscO88940 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MscO88940 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MscO88940 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MscO88940 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
MscO88940 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MscO88940 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MscO88940 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MscO88940 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MscO88940 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
MscO88940 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MscO88940 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
MscO88940 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MscO88940 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MscO88940 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
MscO88940 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MscO88940 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MscO88940 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MscO88940 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MscO88940 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MscO88940 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MscO88940 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MscO88940 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MscO88940 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MscO88940 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
MscO88940 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MscO88940 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MscO88940 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MscO88940 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MscO88940 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MscO88940 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MscO88940 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MscO88940 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MscO88940 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MscO88940 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MscO88940 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MscO88940 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MscO88940 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MscO88940 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MscO88940 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MscO88940 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MscO88940 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MscO88940 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MscO88940 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MscO88940 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MscO88940 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MscO88940 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MscO88940 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MscO88940 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MscO88940 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MscO88940 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MscO88940 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MscO88940 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MscO88940 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MscO88940 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
MscO88940 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MscO88940 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MscO88940 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MscO88940 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MscO88940 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MscO88940 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MscO88940 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MscO88940 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MscO88940 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MscO88940 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MscO88940 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MscO88940 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MscO88940 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MscO88940 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MscO88940 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MscO88940 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MscO88940 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MscO88940 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MscO88940 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MscO88940 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MscO88940 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
MscO88940 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
MscO88940 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms