Protein–RNA interactions for Protein: O88456

Capns1, Calpain small subunit 1, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns1O88456 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capns1O88456 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Capns1O88456 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capns1O88456 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capns1O88456 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capns1O88456 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Capns1O88456 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Capns1O88456 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Capns1O88456 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capns1O88456 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capns1O88456 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capns1O88456 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capns1O88456 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capns1O88456 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capns1O88456 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capns1O88456 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capns1O88456 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capns1O88456 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capns1O88456 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capns1O88456 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capns1O88456 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capns1O88456 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capns1O88456 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capns1O88456 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capns1O88456 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capns1O88456 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capns1O88456 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capns1O88456 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capns1O88456 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capns1O88456 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capns1O88456 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capns1O88456 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capns1O88456 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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