Protein–RNA interactions for Protein: O70401

Tspan6, Tetraspanin-6, mousemouse

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Length 245 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Tspan6O70401 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Tspan6O70401 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Tspan6O70401 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tspan6O70401 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
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Tspan6O70401 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tspan6O70401 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tspan6O70401 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Tspan6O70401 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tspan6O70401 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tspan6O70401 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tspan6O70401 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tspan6O70401 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Tspan6O70401 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tspan6O70401 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms