Protein–RNA interactions for Protein: O55201

Supt5h, Transcription elongation factor SPT5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt5hO55201 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Supt5hO55201 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Supt5hO55201 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Supt5hO55201 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Supt5hO55201 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Supt5hO55201 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Supt5hO55201 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Supt5hO55201 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Supt5hO55201 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Supt5hO55201 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Supt5hO55201 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Supt5hO55201 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Supt5hO55201 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Supt5hO55201 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Supt5hO55201 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Supt5hO55201 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Supt5hO55201 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Supt5hO55201 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Supt5hO55201 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Supt5hO55201 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Supt5hO55201 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Supt5hO55201 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Supt5hO55201 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Supt5hO55201 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Supt5hO55201 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Supt5hO55201 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Supt5hO55201 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Supt5hO55201 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Supt5hO55201 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Supt5hO55201 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Supt5hO55201 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Supt5hO55201 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Supt5hO55201 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Supt5hO55201 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Supt5hO55201 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Supt5hO55201 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Supt5hO55201 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Supt5hO55201 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Supt5hO55201 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Supt5hO55201 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Supt5hO55201 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Supt5hO55201 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Supt5hO55201 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Supt5hO55201 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Supt5hO55201 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Supt5hO55201 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Supt5hO55201 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Supt5hO55201 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Supt5hO55201 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Supt5hO55201 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Supt5hO55201 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Supt5hO55201 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Supt5hO55201 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Supt5hO55201 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Supt5hO55201 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Supt5hO55201 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Supt5hO55201 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Supt5hO55201 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Supt5hO55201 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Supt5hO55201 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Supt5hO55201 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Supt5hO55201 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Supt5hO55201 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Supt5hO55201 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Supt5hO55201 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Supt5hO55201 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Supt5hO55201 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Supt5hO55201 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Supt5hO55201 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Supt5hO55201 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Supt5hO55201 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Supt5hO55201 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Supt5hO55201 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Supt5hO55201 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Supt5hO55201 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Supt5hO55201 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Supt5hO55201 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Supt5hO55201 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Supt5hO55201 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Supt5hO55201 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Supt5hO55201 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Supt5hO55201 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Supt5hO55201 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Supt5hO55201 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Supt5hO55201 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Supt5hO55201 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Supt5hO55201 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Supt5hO55201 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Supt5hO55201 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Supt5hO55201 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Supt5hO55201 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Supt5hO55201 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Supt5hO55201 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Supt5hO55201 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Supt5hO55201 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Supt5hO55201 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Supt5hO55201 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Supt5hO55201 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Supt5hO55201 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Supt5hO55201 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms