Protein–RNA interactions for Protein: O54946

Dnajb6, DnaJ homolog subfamily B member 6, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajb6O54946 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dnajb6O54946 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Dnajb6O54946 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Dnajb6O54946 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Dnajb6O54946 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Dnajb6O54946 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Dnajb6O54946 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Dnajb6O54946 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dnajb6O54946 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dnajb6O54946 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dnajb6O54946 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dnajb6O54946 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dnajb6O54946 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dnajb6O54946 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dnajb6O54946 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dnajb6O54946 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dnajb6O54946 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dnajb6O54946 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dnajb6O54946 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dnajb6O54946 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dnajb6O54946 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dnajb6O54946 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dnajb6O54946 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dnajb6O54946 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dnajb6O54946 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dnajb6O54946 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dnajb6O54946 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dnajb6O54946 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dnajb6O54946 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Dnajb6O54946 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dnajb6O54946 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dnajb6O54946 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dnajb6O54946 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dnajb6O54946 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dnajb6O54946 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dnajb6O54946 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dnajb6O54946 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dnajb6O54946 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dnajb6O54946 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dnajb6O54946 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dnajb6O54946 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Dnajb6O54946 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dnajb6O54946 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dnajb6O54946 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dnajb6O54946 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dnajb6O54946 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dnajb6O54946 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Dnajb6O54946 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dnajb6O54946 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dnajb6O54946 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dnajb6O54946 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dnajb6O54946 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dnajb6O54946 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dnajb6O54946 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dnajb6O54946 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dnajb6O54946 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dnajb6O54946 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dnajb6O54946 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dnajb6O54946 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dnajb6O54946 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dnajb6O54946 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dnajb6O54946 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dnajb6O54946 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms