Protein–RNA interactions for Protein: O35492

Clk3, Dual specificity protein kinase CLK3, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk3O35492 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clk3O35492 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clk3O35492 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clk3O35492 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clk3O35492 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clk3O35492 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clk3O35492 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clk3O35492 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clk3O35492 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clk3O35492 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clk3O35492 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clk3O35492 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clk3O35492 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Clk3O35492 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clk3O35492 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clk3O35492 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clk3O35492 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clk3O35492 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clk3O35492 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clk3O35492 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clk3O35492 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clk3O35492 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clk3O35492 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clk3O35492 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clk3O35492 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clk3O35492 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clk3O35492 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clk3O35492 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clk3O35492 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clk3O35492 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clk3O35492 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clk3O35492 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clk3O35492 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clk3O35492 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clk3O35492 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clk3O35492 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clk3O35492 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clk3O35492 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clk3O35492 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clk3O35492 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clk3O35492 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clk3O35492 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clk3O35492 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clk3O35492 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clk3O35492 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms