Protein–RNA interactions for Protein: O35350

Capn1, Calpain-1 catalytic subunit, mousemouse

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Length 713 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn1O35350 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capn1O35350 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capn1O35350 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capn1O35350 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capn1O35350 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Capn1O35350 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capn1O35350 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capn1O35350 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capn1O35350 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capn1O35350 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capn1O35350 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capn1O35350 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capn1O35350 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capn1O35350 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capn1O35350 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capn1O35350 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capn1O35350 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Capn1O35350 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capn1O35350 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capn1O35350 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capn1O35350 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capn1O35350 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capn1O35350 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capn1O35350 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capn1O35350 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn1O35350 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn1O35350 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn1O35350 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn1O35350 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn1O35350 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn1O35350 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn1O35350 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn1O35350 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn1O35350 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn1O35350 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn1O35350 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn1O35350 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn1O35350 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn1O35350 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn1O35350 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn1O35350 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn1O35350 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn1O35350 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn1O35350 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn1O35350 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn1O35350 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn1O35350 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn1O35350 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn1O35350 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn1O35350 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn1O35350 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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