Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nedd9O35177 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nedd9O35177 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nedd9O35177 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nedd9O35177 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nedd9O35177 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nedd9O35177 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nedd9O35177 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nedd9O35177 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nedd9O35177 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Nedd9O35177 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nedd9O35177 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nedd9O35177 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nedd9O35177 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Nedd9O35177 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nedd9O35177 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nedd9O35177 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nedd9O35177 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nedd9O35177 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nedd9O35177 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nedd9O35177 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nedd9O35177 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nedd9O35177 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nedd9O35177 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nedd9O35177 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nedd9O35177 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nedd9O35177 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Nedd9O35177 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nedd9O35177 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nedd9O35177 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nedd9O35177 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nedd9O35177 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nedd9O35177 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nedd9O35177 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nedd9O35177 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nedd9O35177 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nedd9O35177 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nedd9O35177 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nedd9O35177 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nedd9O35177 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nedd9O35177 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nedd9O35177 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Nedd9O35177 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nedd9O35177 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nedd9O35177 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nedd9O35177 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nedd9O35177 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nedd9O35177 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nedd9O35177 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nedd9O35177 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nedd9O35177 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nedd9O35177 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nedd9O35177 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nedd9O35177 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nedd9O35177 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nedd9O35177 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nedd9O35177 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nedd9O35177 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nedd9O35177 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nedd9O35177 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nedd9O35177 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nedd9O35177 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nedd9O35177 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nedd9O35177 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nedd9O35177 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nedd9O35177 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nedd9O35177 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nedd9O35177 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nedd9O35177 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nedd9O35177 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nedd9O35177 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nedd9O35177 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nedd9O35177 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nedd9O35177 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nedd9O35177 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nedd9O35177 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nedd9O35177 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nedd9O35177 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nedd9O35177 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nedd9O35177 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nedd9O35177 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nedd9O35177 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nedd9O35177 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nedd9O35177 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nedd9O35177 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nedd9O35177 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nedd9O35177 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nedd9O35177 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nedd9O35177 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nedd9O35177 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nedd9O35177 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nedd9O35177 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nedd9O35177 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Nedd9O35177 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nedd9O35177 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nedd9O35177 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nedd9O35177 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Nedd9O35177 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nedd9O35177 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nedd9O35177 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms