Protein–RNA interactions for Protein: G3XA12

4933406M09Rik, RIKEN cDNA 4933406M09, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933406M09RikG3XA12 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
4933406M09RikG3XA12 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4933406M09RikG3XA12 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
4933406M09RikG3XA12 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
4933406M09RikG3XA12 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4933406M09RikG3XA12 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
4933406M09RikG3XA12 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4933406M09RikG3XA12 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4933406M09RikG3XA12 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
4933406M09RikG3XA12 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4933406M09RikG3XA12 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4933406M09RikG3XA12 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
4933406M09RikG3XA12 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
4933406M09RikG3XA12 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4933406M09RikG3XA12 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4933406M09RikG3XA12 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4933406M09RikG3XA12 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4933406M09RikG3XA12 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
4933406M09RikG3XA12 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4933406M09RikG3XA12 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4933406M09RikG3XA12 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4933406M09RikG3XA12 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4933406M09RikG3XA12 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4933406M09RikG3XA12 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
4933406M09RikG3XA12 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4933406M09RikG3XA12 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
4933406M09RikG3XA12 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
4933406M09RikG3XA12 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
4933406M09RikG3XA12 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4933406M09RikG3XA12 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4933406M09RikG3XA12 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4933406M09RikG3XA12 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4933406M09RikG3XA12 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4933406M09RikG3XA12 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
4933406M09RikG3XA12 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
4933406M09RikG3XA12 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
4933406M09RikG3XA12 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4933406M09RikG3XA12 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4933406M09RikG3XA12 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4933406M09RikG3XA12 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4933406M09RikG3XA12 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4933406M09RikG3XA12 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
4933406M09RikG3XA12 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4933406M09RikG3XA12 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
4933406M09RikG3XA12 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
4933406M09RikG3XA12 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
4933406M09RikG3XA12 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4933406M09RikG3XA12 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4933406M09RikG3XA12 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4933406M09RikG3XA12 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4933406M09RikG3XA12 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4933406M09RikG3XA12 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4933406M09RikG3XA12 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4933406M09RikG3XA12 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
4933406M09RikG3XA12 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4933406M09RikG3XA12 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4933406M09RikG3XA12 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4933406M09RikG3XA12 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4933406M09RikG3XA12 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4933406M09RikG3XA12 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4933406M09RikG3XA12 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
4933406M09RikG3XA12 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4933406M09RikG3XA12 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4933406M09RikG3XA12 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4933406M09RikG3XA12 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4933406M09RikG3XA12 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4933406M09RikG3XA12 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
4933406M09RikG3XA12 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4933406M09RikG3XA12 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
4933406M09RikG3XA12 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
4933406M09RikG3XA12 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
4933406M09RikG3XA12 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4933406M09RikG3XA12 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4933406M09RikG3XA12 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4933406M09RikG3XA12 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
4933406M09RikG3XA12 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
4933406M09RikG3XA12 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4933406M09RikG3XA12 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4933406M09RikG3XA12 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4933406M09RikG3XA12 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
4933406M09RikG3XA12 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4933406M09RikG3XA12 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4933406M09RikG3XA12 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4933406M09RikG3XA12 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4933406M09RikG3XA12 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4933406M09RikG3XA12 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
4933406M09RikG3XA12 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
4933406M09RikG3XA12 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4933406M09RikG3XA12 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
4933406M09RikG3XA12 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
4933406M09RikG3XA12 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4933406M09RikG3XA12 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4933406M09RikG3XA12 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
4933406M09RikG3XA12 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4933406M09RikG3XA12 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4933406M09RikG3XA12 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4933406M09RikG3XA12 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
4933406M09RikG3XA12 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
4933406M09RikG3XA12 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms