Protein–RNA interactions for Protein: G3X9Z4

Pcf11, Cleavage and polyadenylation factor subunit homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Predictions only

Length 1,553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcf11G3X9Z4 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pcf11G3X9Z4 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pcf11G3X9Z4 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pcf11G3X9Z4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pcf11G3X9Z4 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pcf11G3X9Z4 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pcf11G3X9Z4 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pcf11G3X9Z4 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pcf11G3X9Z4 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pcf11G3X9Z4 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pcf11G3X9Z4 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pcf11G3X9Z4 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Pcf11G3X9Z4 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pcf11G3X9Z4 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pcf11G3X9Z4 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pcf11G3X9Z4 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pcf11G3X9Z4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pcf11G3X9Z4 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pcf11G3X9Z4 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pcf11G3X9Z4 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pcf11G3X9Z4 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pcf11G3X9Z4 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pcf11G3X9Z4 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pcf11G3X9Z4 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pcf11G3X9Z4 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pcf11G3X9Z4 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pcf11G3X9Z4 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pcf11G3X9Z4 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pcf11G3X9Z4 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pcf11G3X9Z4 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pcf11G3X9Z4 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pcf11G3X9Z4 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pcf11G3X9Z4 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pcf11G3X9Z4 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pcf11G3X9Z4 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pcf11G3X9Z4 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pcf11G3X9Z4 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pcf11G3X9Z4 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pcf11G3X9Z4 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pcf11G3X9Z4 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pcf11G3X9Z4 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pcf11G3X9Z4 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pcf11G3X9Z4 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pcf11G3X9Z4 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pcf11G3X9Z4 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pcf11G3X9Z4 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pcf11G3X9Z4 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pcf11G3X9Z4 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Pcf11G3X9Z4 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pcf11G3X9Z4 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pcf11G3X9Z4 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pcf11G3X9Z4 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pcf11G3X9Z4 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pcf11G3X9Z4 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pcf11G3X9Z4 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pcf11G3X9Z4 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pcf11G3X9Z4 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pcf11G3X9Z4 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pcf11G3X9Z4 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pcf11G3X9Z4 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pcf11G3X9Z4 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pcf11G3X9Z4 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pcf11G3X9Z4 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pcf11G3X9Z4 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pcf11G3X9Z4 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pcf11G3X9Z4 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pcf11G3X9Z4 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Pcf11G3X9Z4 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pcf11G3X9Z4 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pcf11G3X9Z4 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pcf11G3X9Z4 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pcf11G3X9Z4 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pcf11G3X9Z4 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pcf11G3X9Z4 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pcf11G3X9Z4 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pcf11G3X9Z4 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pcf11G3X9Z4 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Pcf11G3X9Z4 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pcf11G3X9Z4 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pcf11G3X9Z4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pcf11G3X9Z4 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pcf11G3X9Z4 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pcf11G3X9Z4 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pcf11G3X9Z4 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pcf11G3X9Z4 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pcf11G3X9Z4 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pcf11G3X9Z4 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pcf11G3X9Z4 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pcf11G3X9Z4 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pcf11G3X9Z4 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pcf11G3X9Z4 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Pcf11G3X9Z4 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Pcf11G3X9Z4 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pcf11G3X9Z4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pcf11G3X9Z4 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pcf11G3X9Z4 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pcf11G3X9Z4 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pcf11G3X9Z4 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pcf11G3X9Z4 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pcf11G3X9Z4 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms