Protein–RNA interactions for Protein: G3UY57

Trim15, Tripartite motif protein 15, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim15G3UY57 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trim15G3UY57 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trim15G3UY57 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim15G3UY57 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim15G3UY57 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim15G3UY57 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim15G3UY57 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trim15G3UY57 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim15G3UY57 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim15G3UY57 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Trim15G3UY57 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim15G3UY57 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim15G3UY57 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim15G3UY57 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim15G3UY57 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Trim15G3UY57 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim15G3UY57 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim15G3UY57 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim15G3UY57 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trim15G3UY57 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim15G3UY57 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim15G3UY57 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim15G3UY57 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim15G3UY57 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim15G3UY57 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim15G3UY57 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim15G3UY57 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim15G3UY57 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim15G3UY57 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim15G3UY57 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim15G3UY57 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim15G3UY57 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim15G3UY57 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trim15G3UY57 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim15G3UY57 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim15G3UY57 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim15G3UY57 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim15G3UY57 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim15G3UY57 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim15G3UY57 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim15G3UY57 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim15G3UY57 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim15G3UY57 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim15G3UY57 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim15G3UY57 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim15G3UY57 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim15G3UY57 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim15G3UY57 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim15G3UY57 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim15G3UY57 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim15G3UY57 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim15G3UY57 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim15G3UY57 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim15G3UY57 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim15G3UY57 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim15G3UY57 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim15G3UY57 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim15G3UY57 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim15G3UY57 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim15G3UY57 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim15G3UY57 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim15G3UY57 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim15G3UY57 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim15G3UY57 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim15G3UY57 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim15G3UY57 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim15G3UY57 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim15G3UY57 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim15G3UY57 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim15G3UY57 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim15G3UY57 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trim15G3UY57 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trim15G3UY57 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim15G3UY57 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trim15G3UY57 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trim15G3UY57 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ 0
Trim15G3UY57 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ 0
Trim15G3UY57 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trim15G3UY57 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim15G3UY57 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim15G3UY57 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim15G3UY57 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim15G3UY57 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim15G3UY57 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trim15G3UY57 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim15G3UY57 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim15G3UY57 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim15G3UY57 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim15G3UY57 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim15G3UY57 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim15G3UY57 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim15G3UY57 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim15G3UY57 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim15G3UY57 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim15G3UY57 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trim15G3UY57 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim15G3UY57 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trim15G3UY57 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim15G3UY57 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim15G3UY57 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms