Protein–RNA interactions for Protein: F6UK53

4933403O08Rik, MCG62900, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933403O08RikF6UK53 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms