Protein–RNA interactions for Protein: F2Z3U3

Raph1, Ras association (RalGDS/AF-6) and pleckstrin homology domains 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Raph1F2Z3U3 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Raph1F2Z3U3 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Raph1F2Z3U3 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Raph1F2Z3U3 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Raph1F2Z3U3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Raph1F2Z3U3 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Raph1F2Z3U3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Raph1F2Z3U3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Raph1F2Z3U3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Raph1F2Z3U3 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Raph1F2Z3U3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Raph1F2Z3U3 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Raph1F2Z3U3 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Raph1F2Z3U3 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Raph1F2Z3U3 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Raph1F2Z3U3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Raph1F2Z3U3 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Raph1F2Z3U3 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Raph1F2Z3U3 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Raph1F2Z3U3 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Raph1F2Z3U3 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Raph1F2Z3U3 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Raph1F2Z3U3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Raph1F2Z3U3 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Raph1F2Z3U3 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Raph1F2Z3U3 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Raph1F2Z3U3 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Raph1F2Z3U3 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Raph1F2Z3U3 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Raph1F2Z3U3 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Raph1F2Z3U3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Raph1F2Z3U3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Raph1F2Z3U3 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Raph1F2Z3U3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Raph1F2Z3U3 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Raph1F2Z3U3 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Raph1F2Z3U3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Raph1F2Z3U3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Raph1F2Z3U3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Raph1F2Z3U3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Raph1F2Z3U3 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Raph1F2Z3U3 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Raph1F2Z3U3 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Raph1F2Z3U3 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Raph1F2Z3U3 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Raph1F2Z3U3 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Raph1F2Z3U3 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Raph1F2Z3U3 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Raph1F2Z3U3 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Raph1F2Z3U3 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Raph1F2Z3U3 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Raph1F2Z3U3 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Raph1F2Z3U3 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Raph1F2Z3U3 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Raph1F2Z3U3 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Raph1F2Z3U3 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Raph1F2Z3U3 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Raph1F2Z3U3 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Raph1F2Z3U3 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Raph1F2Z3U3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Raph1F2Z3U3 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Raph1F2Z3U3 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Raph1F2Z3U3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Raph1F2Z3U3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Raph1F2Z3U3 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Raph1F2Z3U3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Raph1F2Z3U3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Raph1F2Z3U3 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Raph1F2Z3U3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Raph1F2Z3U3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Raph1F2Z3U3 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Raph1F2Z3U3 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Raph1F2Z3U3 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Raph1F2Z3U3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Raph1F2Z3U3 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Raph1F2Z3U3 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Raph1F2Z3U3 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Raph1F2Z3U3 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Raph1F2Z3U3 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Raph1F2Z3U3 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Raph1F2Z3U3 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Raph1F2Z3U3 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Raph1F2Z3U3 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Raph1F2Z3U3 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Raph1F2Z3U3 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Raph1F2Z3U3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Raph1F2Z3U3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Raph1F2Z3U3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Raph1F2Z3U3 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Raph1F2Z3U3 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Raph1F2Z3U3 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Raph1F2Z3U3 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Raph1F2Z3U3 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Raph1F2Z3U3 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Raph1F2Z3U3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Raph1F2Z3U3 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Raph1F2Z3U3 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Raph1F2Z3U3 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Raph1F2Z3U3 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Raph1F2Z3U3 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms