Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Y3

Ccdc7b, Coiled-coil domain-containing 7B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7bE9Q9Y3 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms