Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Myo5cE9Q1F5 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Myo5cE9Q1F5 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Myo5cE9Q1F5 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Myo5cE9Q1F5 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Myo5cE9Q1F5 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Myo5cE9Q1F5 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Myo5cE9Q1F5 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Myo5cE9Q1F5 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Myo5cE9Q1F5 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Myo5cE9Q1F5 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Myo5cE9Q1F5 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Myo5cE9Q1F5 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Myo5cE9Q1F5 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Myo5cE9Q1F5 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Myo5cE9Q1F5 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Myo5cE9Q1F5 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Myo5cE9Q1F5 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Myo5cE9Q1F5 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Myo5cE9Q1F5 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Myo5cE9Q1F5 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Myo5cE9Q1F5 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Myo5cE9Q1F5 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Myo5cE9Q1F5 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Myo5cE9Q1F5 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Myo5cE9Q1F5 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Myo5cE9Q1F5 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Myo5cE9Q1F5 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Myo5cE9Q1F5 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Myo5cE9Q1F5 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Myo5cE9Q1F5 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Myo5cE9Q1F5 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Myo5cE9Q1F5 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Myo5cE9Q1F5 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Myo5cE9Q1F5 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Myo5cE9Q1F5 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Myo5cE9Q1F5 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Myo5cE9Q1F5 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Myo5cE9Q1F5 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Myo5cE9Q1F5 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Myo5cE9Q1F5 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Myo5cE9Q1F5 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Myo5cE9Q1F5 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Myo5cE9Q1F5 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Myo5cE9Q1F5 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Myo5cE9Q1F5 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Myo5cE9Q1F5 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Myo5cE9Q1F5 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Myo5cE9Q1F5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Myo5cE9Q1F5 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Myo5cE9Q1F5 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Myo5cE9Q1F5 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Myo5cE9Q1F5 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Myo5cE9Q1F5 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Myo5cE9Q1F5 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Myo5cE9Q1F5 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Myo5cE9Q1F5 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Myo5cE9Q1F5 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Myo5cE9Q1F5 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Myo5cE9Q1F5 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Myo5cE9Q1F5 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Myo5cE9Q1F5 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Myo5cE9Q1F5 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Myo5cE9Q1F5 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Myo5cE9Q1F5 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Myo5cE9Q1F5 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Myo5cE9Q1F5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Myo5cE9Q1F5 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Myo5cE9Q1F5 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Myo5cE9Q1F5 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Myo5cE9Q1F5 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Myo5cE9Q1F5 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Myo5cE9Q1F5 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Myo5cE9Q1F5 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Myo5cE9Q1F5 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Myo5cE9Q1F5 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Myo5cE9Q1F5 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Myo5cE9Q1F5 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Myo5cE9Q1F5 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Myo5cE9Q1F5 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Myo5cE9Q1F5 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Myo5cE9Q1F5 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Myo5cE9Q1F5 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Myo5cE9Q1F5 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Myo5cE9Q1F5 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Myo5cE9Q1F5 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Myo5cE9Q1F5 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Myo5cE9Q1F5 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Myo5cE9Q1F5 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Myo5cE9Q1F5 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Myo5cE9Q1F5 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Myo5cE9Q1F5 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Myo5cE9Q1F5 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Myo5cE9Q1F5 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Myo5cE9Q1F5 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Myo5cE9Q1F5 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Myo5cE9Q1F5 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Myo5cE9Q1F5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Myo5cE9Q1F5 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Myo5cE9Q1F5 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
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