Protein–RNA interactions for Protein: E9PW74

Gimd1, GTPase IMAP family member GIMD1, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gimd1E9PW74 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gimd1E9PW74 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gimd1E9PW74 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gimd1E9PW74 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gimd1E9PW74 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gimd1E9PW74 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gimd1E9PW74 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gimd1E9PW74 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gimd1E9PW74 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gimd1E9PW74 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Gimd1E9PW74 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gimd1E9PW74 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gimd1E9PW74 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gimd1E9PW74 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gimd1E9PW74 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gimd1E9PW74 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gimd1E9PW74 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gimd1E9PW74 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gimd1E9PW74 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Gimd1E9PW74 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gimd1E9PW74 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gimd1E9PW74 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gimd1E9PW74 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Gimd1E9PW74 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gimd1E9PW74 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gimd1E9PW74 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Gimd1E9PW74 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gimd1E9PW74 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gimd1E9PW74 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gimd1E9PW74 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gimd1E9PW74 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gimd1E9PW74 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gimd1E9PW74 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gimd1E9PW74 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gimd1E9PW74 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gimd1E9PW74 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gimd1E9PW74 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gimd1E9PW74 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gimd1E9PW74 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gimd1E9PW74 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gimd1E9PW74 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gimd1E9PW74 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gimd1E9PW74 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gimd1E9PW74 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gimd1E9PW74 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gimd1E9PW74 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gimd1E9PW74 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gimd1E9PW74 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gimd1E9PW74 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gimd1E9PW74 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gimd1E9PW74 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gimd1E9PW74 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gimd1E9PW74 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Gimd1E9PW74 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Gimd1E9PW74 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gimd1E9PW74 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gimd1E9PW74 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gimd1E9PW74 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gimd1E9PW74 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gimd1E9PW74 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gimd1E9PW74 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gimd1E9PW74 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gimd1E9PW74 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gimd1E9PW74 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gimd1E9PW74 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gimd1E9PW74 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gimd1E9PW74 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gimd1E9PW74 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gimd1E9PW74 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gimd1E9PW74 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gimd1E9PW74 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gimd1E9PW74 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gimd1E9PW74 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gimd1E9PW74 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Gimd1E9PW74 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gimd1E9PW74 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Gimd1E9PW74 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gimd1E9PW74 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gimd1E9PW74 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gimd1E9PW74 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gimd1E9PW74 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gimd1E9PW74 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gimd1E9PW74 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gimd1E9PW74 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gimd1E9PW74 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gimd1E9PW74 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gimd1E9PW74 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gimd1E9PW74 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gimd1E9PW74 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gimd1E9PW74 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gimd1E9PW74 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gimd1E9PW74 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gimd1E9PW74 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gimd1E9PW74 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gimd1E9PW74 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gimd1E9PW74 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gimd1E9PW74 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gimd1E9PW74 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gimd1E9PW74 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gimd1E9PW74 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms