Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms