Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phf11bB4XVQ1 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phf11bB4XVQ1 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phf11bB4XVQ1 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phf11bB4XVQ1 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phf11bB4XVQ1 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phf11bB4XVQ1 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phf11bB4XVQ1 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phf11bB4XVQ1 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phf11bB4XVQ1 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phf11bB4XVQ1 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phf11bB4XVQ1 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phf11bB4XVQ1 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phf11bB4XVQ1 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phf11bB4XVQ1 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Phf11bB4XVQ1 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phf11bB4XVQ1 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phf11bB4XVQ1 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Phf11bB4XVQ1 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Phf11bB4XVQ1 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phf11bB4XVQ1 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phf11bB4XVQ1 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phf11bB4XVQ1 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phf11bB4XVQ1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phf11bB4XVQ1 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phf11bB4XVQ1 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phf11bB4XVQ1 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phf11bB4XVQ1 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phf11bB4XVQ1 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phf11bB4XVQ1 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phf11bB4XVQ1 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phf11bB4XVQ1 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phf11bB4XVQ1 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phf11bB4XVQ1 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phf11bB4XVQ1 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phf11bB4XVQ1 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phf11bB4XVQ1 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phf11bB4XVQ1 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phf11bB4XVQ1 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phf11bB4XVQ1 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phf11bB4XVQ1 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Phf11bB4XVQ1 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Phf11bB4XVQ1 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phf11bB4XVQ1 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Phf11bB4XVQ1 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Phf11bB4XVQ1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Phf11bB4XVQ1 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Phf11bB4XVQ1 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Phf11bB4XVQ1 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Phf11bB4XVQ1 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Phf11bB4XVQ1 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Phf11bB4XVQ1 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Phf11bB4XVQ1 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Phf11bB4XVQ1 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phf11bB4XVQ1 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Phf11bB4XVQ1 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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