Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 AC051619.2-201ENST00000559063 397 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
USP20Q9Y2K6 AL355073.1-201ENST00000560296 517 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP20Q9Y2K6 AC005341.1-201ENST00000571086 708 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
USP20Q9Y2K6 AC007193.1-201ENST00000599645 448 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP20Q9Y2K6 AL031666.3-201ENST00000609320 1006 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
USP20Q9Y2K6 AC098617.1-203ENST00000609865 277 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP20Q9Y2K6 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
USP20Q9Y2K6 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
USP20Q9Y2K6 AC123768.4-201ENST00000616244 701 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
USP20Q9Y2K6 AL049794.2-201ENST00000616301 365 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
USP20Q9Y2K6 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP20Q9Y2K6 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP20Q9Y2K6 ADGRF5-201ENST00000265417 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP20Q9Y2K6 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP20Q9Y2K6 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP20Q9Y2K6 ZFAND6-223ENST00000616533 1653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP20Q9Y2K6 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP20Q9Y2K6 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP20Q9Y2K6 NPIPB9-201ENST00000357796 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
USP20Q9Y2K6 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
USP20Q9Y2K6 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
USP20Q9Y2K6 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP20Q9Y2K6 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP20Q9Y2K6 MUC17-201ENST00000306151 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP20Q9Y2K6 AC009951.1-201ENST00000623674 2614 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP20Q9Y2K6 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP20Q9Y2K6 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP20Q9Y2K6 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP20Q9Y2K6 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP20Q9Y2K6 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP20Q9Y2K6 RNU1-106P-201ENST00000384382 164 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP20Q9Y2K6 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP20Q9Y2K6 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP20Q9Y2K6 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP20Q9Y2K6 LINC02542-201ENST00000418567 822 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP20Q9Y2K6 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP20Q9Y2K6 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP20Q9Y2K6 FABP7P2-201ENST00000429946 379 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP20Q9Y2K6 AL121974.1-201ENST00000437859 377 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP20Q9Y2K6 PRPF38AP2-201ENST00000438179 851 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP20Q9Y2K6 AC105402.2-201ENST00000438503 358 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP20Q9Y2K6 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP20Q9Y2K6 PTMAP6-201ENST00000439110 327 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP20Q9Y2K6 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP20Q9Y2K6 RPL23AP43-201ENST00000446445 471 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP20Q9Y2K6 GAPDHP25-201ENST00000447061 1001 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP20Q9Y2K6 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP20Q9Y2K6 AC093270.2-201ENST00000486157 792 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP20Q9Y2K6 LINC02508-201ENST00000504165 426 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP20Q9Y2K6 AC016559.2-201ENST00000510759 359 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP20Q9Y2K6 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP20Q9Y2K6 HMGN1P9-201ENST00000515212 298 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP20Q9Y2K6 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP20Q9Y2K6 MAL2-208ENST00000523307 556 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP20Q9Y2K6 CARD16-203ENST00000525374 503 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP20Q9Y2K6 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP20Q9Y2K6 AC002563.1-201ENST00000535109 451 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP20Q9Y2K6 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP20Q9Y2K6 AC114684.1-201ENST00000587659 352 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP20Q9Y2K6 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP20Q9Y2K6 MAPKAPK5-AS1-205ENST00000590479 543 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP20Q9Y2K6 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP20Q9Y2K6 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP20Q9Y2K6 AL591926.2-202ENST00000615199 719 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP20Q9Y2K6 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP20Q9Y2K6 AC018445.2-201ENST00000622987 260 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP20Q9Y2K6 SLC8A1-AS1-239ENST00000631142 623 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP20Q9Y2K6 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP20Q9Y2K6 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP20Q9Y2K6 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP20Q9Y2K6 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP20Q9Y2K6 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP20Q9Y2K6 HTR1F-201ENST00000319595 3140 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP20Q9Y2K6 SLC4A10-202ENST00000375514 5710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP20Q9Y2K6 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP20Q9Y2K6 ZNF273-204ENST00000476120 2000 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP20Q9Y2K6 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP20Q9Y2K6 FAM114A2-210ENST00000520313 1394 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP20Q9Y2K6 BDP1P-201ENST00000582658 1990 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
USP20Q9Y2K6 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP20Q9Y2K6 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP20Q9Y2K6 AL122126.1-201ENST00000546905 1318 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
USP20Q9Y2K6 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP20Q9Y2K6 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
USP20Q9Y2K6 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP20Q9Y2K6 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
USP20Q9Y2K6 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP20Q9Y2K6 AC091046.3-201ENST00000631455 1574 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
USP20Q9Y2K6 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP20Q9Y2K6 RPL32P3-201ENST00000359025 275 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
USP20Q9Y2K6 U8.4-201ENST00000363626 134 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
USP20Q9Y2K6 RNU1-130P-201ENST00000363930 160 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
USP20Q9Y2K6 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
USP20Q9Y2K6 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
USP20Q9Y2K6 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP20Q9Y2K6 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP20Q9Y2K6 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
USP20Q9Y2K6 RPL31P12-201ENST00000422587 358 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
USP20Q9Y2K6 RPL23AP38-201ENST00000423801 469 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
USP20Q9Y2K6 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143 ms