Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
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SNAPC1Q16533 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 SATB1-AS1-207ENST00000593741 955 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 NIFKP6-201ENST00000598115 845 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 ELOCP35-201ENST00000604289 336 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 AC018638.7-201ENST00000605836 1114 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
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SNAPC1Q16533 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
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SNAPC1Q16533 AC092142.2-201ENST00000614642 354 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
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SNAPC1Q16533 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 AC091304.6-201ENST00000619761 202 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 AL139089.1-201ENST00000620372 975 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 AC244205.2-202ENST00000635781 342 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
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SNAPC1Q16533 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 FAM126A-204ENST00000432176 13177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
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SNAPC1Q16533 EQTN-202ENST00000380032 1033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
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SNAPC1Q16533 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
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SNAPC1Q16533 DLG1-217ENST00000452595 3053 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
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SNAPC1Q16533 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
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SNAPC1Q16533 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 AL672167.1-206ENST00000356293 943 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
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