Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 AC023442.2-201ENST00000526455 270 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 LINC01491-202ENST00000558792 439 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 AC136624.4-201ENST00000573044 370 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 LAMTOR5-AS1-203ENST00000585330 463 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC2.19□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 AC011472.4-201ENST00000615848 491 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 C8orf89-202ENST00000624510 658 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 MIR323B-201ENST00000385269 82 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 AC096533.1-201ENST00000411645 353 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 AL157378.1-201ENST00000424506 265 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 AC009220.1-201ENST00000451614 275 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 RPL5P13-201ENST00000462840 709 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 NUDT6-203ENST00000502270 678 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 AC104115.2-201ENST00000523026 687 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 ISCA1P3-201ENST00000577104 373 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 STATH-208ENST00000615994 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 AP000526.1-201ENST00000603308 1388 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 AL645568.2-201ENST00000432815 1337 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 AL359715.4-201ENST00000606629 1436 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 C1orf146-201ENST00000370373 871 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 IL6ST-204ENST00000381293 612 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.17□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 AC007064.3-201ENST00000422608 359 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 AL603910.1-201ENST00000423099 370 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 LINC01867-201ENST00000435357 604 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 AC072062.1-204ENST00000437897 1132 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC2.17□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 SOX2-OT-207ENST00000476964 606 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 AP003717.3-201ENST00000544832 1180 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 AC004943.1-201ENST00000620814 561 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 AL355480.1-201ENST00000629041 99 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 TAS2R15P-201ENST00000390674 928 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 HMGB1P5-202ENST00000451497 985 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 EIF4E-208ENST00000505992 898 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 AC010306.1-201ENST00000523223 1117 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 AC073487.1-201ENST00000547009 529 ntTSL 4 BASIC2.16□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 SMARCA2-229ENST00000634781 1106 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC2.16□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
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