Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 AC004824.1-201ENST00000439577 311 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 AC011753.3-201ENST00000443436 406 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 CEACAMP7-201ENST00000444105 496 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 AL354714.3-201ENST00000447284 493 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 AC104651.2-201ENST00000447549 528 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 RPS17P13-201ENST00000448974 407 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 UBDP1-202ENST00000457888 382 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 RPL7AP6-201ENST00000477943 801 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 AC107027.1-201ENST00000503006 575 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 COX6B1P5-201ENST00000509843 249 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 Y_RNA.719-201ENST00000517156 106 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 AC044860.2-201ENST00000561005 179 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 RPL12P25-202ENST00000598100 674 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 AC087763.1-201ENST00000603391 286 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 AC010680.4-201ENST00000605334 543 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 AL627230.1-201ENST00000613077 211 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 EIF3FP1-201ENST00000613970 806 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 AL591926.8-201ENST00000616876 211 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 AC008505.1-205ENST00000637847 703 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 OR5T1-201ENST00000641368 1118 ntAPPRIS P1 BASIC4.39□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 GHR-213ENST00000622294 4312 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 MFSD4BP1-201ENST00000513330 1552 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 LINC00622-201ENST00000562811 1570 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 FAM197Y3-202ENST00000427622 2325 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 SMAD5-212ENST00000545620 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 RAPH1-203ENST00000374493 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 PNPLA8-204ENST00000426128 4268 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 NPSR1-AS1-205ENST00000436945 1406 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 OR5M3-202ENST00000641993 1400 ntAPPRIS P1 BASIC4.38□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 AC096751.1-201ENST00000515178 2202 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 SLC9B1-202ENST00000394789 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 SLC17A1-204ENST00000476801 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 N4BP2L2-201ENST00000267068 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 SLC17A4-201ENST00000377905 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC4.38□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 AL360270.1-201ENST00000440689 2359 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.38□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 SNORA70-201ENST00000384436 135 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC4.38□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 IL6-206ENST00000407492 926 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 AL138826.1-202ENST00000415106 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 IGKV1OR9-1-201ENST00000424370 284 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 RHOT1P3-201ENST00000436571 331 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 PTMAP6-201ENST00000439110 327 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 AL034349.1-201ENST00000458367 549 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 AC108022.1-201ENST00000493466 478 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 PPBPP1-201ENST00000510807 373 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 CDV3-208ENST00000511392 554 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 FTH1P21-201ENST00000512179 511 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 AC107373.1-201ENST00000522570 603 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 LINC01619-209ENST00000552277 571 ntTSL 4 BASIC4.38□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 LINC00520-201ENST00000554186 831 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98 ms