Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 PPFIA2-AS1-202ENST00000549161 1080 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 AC090971.2-201ENST00000558142 510 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 AC090953.1-201ENST00000604305 1092 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 CFHR4-203ENST00000367418 1066 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 AL138787.1-202ENST00000437804 898 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 MTCYBP31-201ENST00000438855 1122 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 AL645939.1-201ENST00000453429 797 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 AL161896.1-201ENST00000597248 508 ntTSL 4 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 AC010680.4-201ENST00000605334 543 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 C8orf89-201ENST00000613105 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 AL162233.1-201ENST00000620014 944 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 AC034244.2-201ENST00000514668 858 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 AC087636.1-201ENST00000554787 573 ntTSL 4 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 AC007906.1-201ENST00000568648 510 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 AC067838.1-201ENST00000606064 577 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 AC117529.2-201ENST00000512159 2068 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 AP000695.2-201ENST00000428667 715 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 AL138799.2-201ENST00000439024 343 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 AC099677.4-201ENST00000446786 380 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 AC068587.2-201ENST00000478386 781 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 LINC02430-201ENST00000504755 476 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 CR589904.2-201ENST00000612533 440 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 SLC35A1-205ENST00000622775 1206 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 AC012594.1-272ENST00000625790 710 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 CGA-204ENST00000627148 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
CACNA1CQ13936 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 AC022022.1-201ENST00000430304 178 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 VN1R96P-201ENST00000446052 858 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 NR1H5P-201ENST00000452683 1377 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 MIR142-201ENST00000384835 87 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 AC009502.1-203ENST00000416861 496 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 SATB1-AS1-204ENST00000453361 726 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 DAOA-AS1_1.1-201ENST00000613021 201 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 ALG6-201ENST00000263440 1895 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 DEFB127-201ENST00000382388 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 GYPE-202ENST00000437468 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 TVP23BP2-201ENST00000455082 615 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 AC104090.1-201ENST00000506341 1171 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 MTND4P2-201ENST00000507767 1203 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 XKRY-201ENST00000510392 1100 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
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