Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 OR52B1P-201ENST00000316506 909 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
ATRQ13535 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
ATRQ13535 RPL31P1-201ENST00000398116 372 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
ATRQ13535 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
ATRQ13535 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
ATRQ13535 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
ATRQ13535 AC013410.1-201ENST00000436223 1232 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
ATRQ13535 AC008278.2-201ENST00000438178 409 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.12
ATRQ13535 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.12
ATRQ13535 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
ATRQ13535 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
ATRQ13535 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.12
ATRQ13535 STARD13-AS-208ENST00000589472 859 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.12
ATRQ13535 AC097717.1-211ENST00000600604 687 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.12
ATRQ13535 AL359715.5-201ENST00000623431 443 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
ATRQ13535 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
ATRQ13535 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ATRQ13535 BPIFC-202ENST00000397450 458 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
ATRQ13535 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ATRQ13535 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ATRQ13535 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
ATRQ13535 MTND3P6-201ENST00000485242 339 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ATRQ13535 AC012625.1-201ENST00000515153 625 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
ATRQ13535 AC018682.2-201ENST00000517716 399 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
ATRQ13535 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC1.83□□□□□ -2.12
ATRQ13535 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ATRQ13535 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
ATRQ13535 LINC01355-202ENST00000604481 400 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
ATRQ13535 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ATRQ13535 ABCA12-202ENST00000389661 7005 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
ATRQ13535 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ATRQ13535 UGP2-203ENST00000445915 1955 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
ATRQ13535 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
ATRQ13535 IQCM-206ENST00000636793 1900 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
ATRQ13535 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
ATRQ13535 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
ATRQ13535 MTATP6P11-201ENST00000428071 670 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ATRQ13535 AC002378.1-201ENST00000432360 298 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
ATRQ13535 AL355306.2-209ENST00000437803 357 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
ATRQ13535 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ATRQ13535 VPS29-210ENST00000552130 1057 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
ATRQ13535 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ATRQ13535 AP005433.1-202ENST00000580845 521 ntTSL 4 BASIC1.83□□□□□ -2.12
ATRQ13535 SLC14A2-AS1-204ENST00000592899 359 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
ATRQ13535 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ATRQ13535 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.83□□□□□ -2.12
ATRQ13535 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ATRQ13535 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
ATRQ13535 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
ATRQ13535 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ATRQ13535 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
ATRQ13535 OR11H5P-202ENST00000641612 1325 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ATRQ13535 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ATRQ13535 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
ATRQ13535 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
ATRQ13535 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ATRQ13535 AL158825.1-201ENST00000414735 521 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ATRQ13535 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ATRQ13535 RPS24P8-201ENST00000431490 402 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ATRQ13535 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
ATRQ13535 AC023632.5-201ENST00000521010 491 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
ATRQ13535 RRAS2-205ENST00000529237 1278 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
ATRQ13535 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ATRQ13535 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ATRQ13535 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ATRQ13535 AC010872.1-201ENST00000624225 675 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ATRQ13535 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
ATRQ13535 IFT80-220ENST00000483465 4044 ntTSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
ATRQ13535 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
ATRQ13535 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ATRQ13535 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ATRQ13535 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ATRQ13535 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ATRQ13535 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ATRQ13535 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ATRQ13535 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
ATRQ13535 AC011611.5-201ENST00000552477 578 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ATRQ13535 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ATRQ13535 AL162233.1-201ENST00000620014 944 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ATRQ13535 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
ATRQ13535 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
ATRQ13535 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
ATRQ13535 MIR423-201ENST00000362201 94 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ATRQ13535 OR51F1-201ENST00000380383 960 ntAPPRIS P5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
ATRQ13535 AL355379.1-201ENST00000405542 640 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ATRQ13535 RN7SKP247-201ENST00000411094 308 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ATRQ13535 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
ATRQ13535 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ATRQ13535 Z73417.1-201ENST00000447373 778 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ATRQ13535 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ATRQ13535 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC1.81□□□□□ -2.12
ATRQ13535 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ATRQ13535 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
ATRQ13535 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
ATRQ13535 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ATRQ13535 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ATRQ13535 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
ATRQ13535 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
ATRQ13535 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
ATRQ13535 ZNF480-202ENST00000335090 2722 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
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