Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 AC026719.1-201ENST00000506059 456 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 CTD-2350J17.1-201ENST00000509228 362 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 AC108210.1-201ENST00000510772 825 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 AC008958.1-201ENST00000511047 682 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 LINC02112-202ENST00000512976 464 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 MTND1P6-201ENST00000523621 946 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 GOLGA8M-203ENST00000568033 557 ntTSL 4 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 AC025627.2-201ENST00000576220 160 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 AC022655.2-201ENST00000577280 318 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 BNIP3P27-201ENST00000599991 412 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 AL606490.9-201ENST00000603331 271 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 AL445423.1-201ENST00000609941 536 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 AL390862.1-201ENST00000635467 1469 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 IL36B-201ENST00000259213 1186 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 PMS1-202ENST00000374826 948 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 COX6B1P7-201ENST00000430845 235 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 GOT2P5-201ENST00000433995 546 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 THAP5P1-201ENST00000439089 262 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 AC093422.2-201ENST00000452599 686 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 MTATP6P14-201ENST00000455189 673 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 PRELID3BP6-201ENST00000503839 571 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 NAT2-202ENST00000520116 716 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 PSMB7P1-201ENST00000556349 514 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 AL355073.1-201ENST00000560296 517 ntTSL 4 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 NUDT7-203ENST00000563839 316 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 DTNA-232ENST00000599844 853 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 AC114878.2-201ENST00000604863 1251 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 AC005014.3-201ENST00000605985 190 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 AC092354.2-201ENST00000607786 514 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CBX3Q13185 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 AC116667.1-201ENST00000604855 2072 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 ZNF679-201ENST00000255746 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 C11orf74-202ENST00000347206 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 XAGE1A-202ENST00000375600 474 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 XAGE1B-202ENST00000375613 474 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 RNU6-1176P-201ENST00000390955 107 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 AL136310.1-201ENST00000404926 654 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 ZNF602P-201ENST00000405929 924 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 MTATP6P20-201ENST00000414147 562 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 AC010967.1-201ENST00000421575 489 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 AL139421.1-201ENST00000423010 169 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 AL357507.1-201ENST00000435946 669 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 CBX1P1-201ENST00000440184 427 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 AF129075.1-201ENST00000457162 794 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
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