Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 AC006116.10-201ENST00000591836 581 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 AC069304.2-201ENST00000605154 435 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 AC021755.1-201ENST00000559747 1447 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 FOXP2-224ENST00000635534 4290 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 C1orf100-202ENST00000366537 483 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 RNU6-1122P-201ENST00000384449 107 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 OFD1P11Y-201ENST00000418213 1177 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 AC079354.3-201ENST00000447111 311 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 LINC02112-202ENST00000512976 464 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 RNU6-1231P-201ENST00000517185 103 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 PIH1D2-206ENST00000528775 1025 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 GTF2IP22-201ENST00000554443 182 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 AP005205.1-201ENST00000563503 508 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 MTND3P13-201ENST00000574391 343 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 AC009704.1-201ENST00000583702 331 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 AC243773.3-201ENST00000613270 256 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 AC025588.4-201ENST00000615802 908 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 AC084824.4-201ENST00000620106 731 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 PCLO-206ENST00000437081 3786 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 TAS2R30-201ENST00000539585 1687 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 CR381670.1-201ENST00000624291 1693 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 C11orf74-201ENST00000334307 863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 C11orf74-202ENST00000347206 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 BBS9-205ENST00000425508 1252 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 DIAPH3-AS2-201ENST00000428656 367 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 AL161640.1-201ENST00000429507 390 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 AL050321.1-201ENST00000432363 400 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 AL645638.1-201ENST00000440519 361 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 ARPC3P2-201ENST00000457786 533 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 AC004801.2-202ENST00000463559 283 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 RPL7L1P8-201ENST00000469911 741 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 OR5AK1P-201ENST00000524837 922 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 AL365503.1-201ENST00000605247 905 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 AC008121.2-201ENST00000614647 523 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 OR6C71P-202ENST00000641886 1107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RPA4Q13156 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.9 ms