Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPRMP28827 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPRMP28827 RNU6-964P-201ENST00000516524 69 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPRMP28827 AP006248.2-201ENST00000623309 592 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPRMP28827 AC016542.2-201ENST00000624201 619 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPRMP28827 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPRMP28827 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPRMP28827 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRMP28827 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRMP28827 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRMP28827 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRMP28827 HSPD1P16-201ENST00000402302 394 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRMP28827 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRMP28827 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRMP28827 AL606490.7-201ENST00000433136 191 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRMP28827 MTND6P18-201ENST00000439477 513 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRMP28827 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRMP28827 SPINK13-202ENST00000511106 661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRMP28827 AC061975.8-201ENST00000587058 721 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRMP28827 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRMP28827 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRMP28827 RGPD1-202ENST00000409776 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPRMP28827 ATP6V1G3-203ENST00000367382 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
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PTPRMP28827 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPRMP28827 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPRMP28827 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPRMP28827 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPRMP28827 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPRMP28827 VN1R17P-201ENST00000472048 1090 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
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PTPRMP28827 AC097512.1-203ENST00000506425 957 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
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PTPRMP28827 AC008728.1-201ENST00000512730 691 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPRMP28827 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
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PTPRMP28827 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPRMP28827 SPAM1-203ENST00000402183 1860 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPRMP28827 AC093775.1-201ENST00000624154 1868 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPRMP28827 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPRMP28827 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
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PTPRMP28827 AP000893.1-201ENST00000474462 794 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPRMP28827 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
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PTPRMP28827 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
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PTPRMP28827 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPRMP28827 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPRMP28827 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPRMP28827 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPRMP28827 AC093311.1-201ENST00000506586 2021 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPRMP28827 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPRMP28827 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
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PTPRMP28827 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPRMP28827 ZBTB8OS-202ENST00000373501 598 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPRMP28827 AL512430.2-201ENST00000406786 339 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
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PTPRMP28827 RNU2-6P-201ENST00000411404 190 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPRMP28827 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPRMP28827 RPL36AP33-201ENST00000450395 310 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPRMP28827 LINC01445-202ENST00000458615 679 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
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PTPRMP28827 AP001992.1-204ENST00000525104 687 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPRMP28827 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
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PTPRMP28827 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPRMP28827 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPRMP28827 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPRMP28827 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPRMP28827 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPRMP28827 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
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