Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRGP23470 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRGP23470 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRGP23470 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRGP23470 BX005019.1-201ENST00000561881 1810 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRGP23470 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRGP23470 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRGP23470 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRGP23470 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRGP23470 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRGP23470 AC007179.2-204ENST00000444001 765 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRGP23470 AC093422.2-201ENST00000452599 686 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRGP23470 LINC01445-202ENST00000458615 679 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRGP23470 ATF7IP2-206ENST00000543967 998 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRGP23470 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRGP23470 AC061975.8-201ENST00000587058 721 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRGP23470 AC006116.7-201ENST00000590141 756 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRGP23470 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRGP23470 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRGP23470 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRGP23470 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRGP23470 MTCO2P17-201ENST00000424336 677 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRGP23470 CACYBPP1-201ENST00000438592 684 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRGP23470 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRGP23470 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRGP23470 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRGP23470 AC007876.1-201ENST00000527562 983 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRGP23470 AC007610.2-201ENST00000566770 666 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRGP23470 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRGP23470 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRGP23470 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRGP23470 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRGP23470 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
PTPRGP23470 DEFB4B-201ENST00000318157 332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 DEFB128-201ENST00000334391 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 KLRC2-202ENST00000381902 1221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 RNU6-1263P-201ENST00000384601 106 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 TVP23BP2-201ENST00000455082 615 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 RPL21P18-201ENST00000469899 480 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 INTS6-AS1-210ENST00000595424 301 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 AL353771.1-201ENST00000422107 457 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 VN1R17P-201ENST00000472048 1090 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 AC012170.1-201ENST00000495139 359 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 LINC02488-201ENST00000504287 652 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 AC117522.2-201ENST00000510049 657 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 STX19-201ENST00000315099 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 AC099060.1-201ENST00000427806 448 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 RAB9AP5-201ENST00000437794 597 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 RAB9AP2-201ENST00000443911 597 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 RPS27P5-201ENST00000444247 244 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 LINC00888-204ENST00000487386 421 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 MTCYBP20-201ENST00000524239 1129 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 AC072062.1-205ENST00000595058 962 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 AC016877.3-201ENST00000606778 504 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 ATP13A5-205ENST00000620313 709 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 GPR34-203ENST00000620846 1282 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 GSTA12P-201ENST00000402398 508 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 CCDC179-202ENST00000532798 791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.1 ms