Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 ACTR3BP5-201ENST00000448440 1479 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 GHR-211ENST00000618088 4491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 OR6K3-201ENST00000368145 1844 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 AC018628.1-201ENST00000624147 3819 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 RBPJP2-201ENST00000618187 1444 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 ANKRD30A-204ENST00000602533 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 ADGRF5-201ENST00000265417 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 DEFB128-201ENST00000334391 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 RN7SKP106-201ENST00000410832 272 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 AC018832.1-201ENST00000428171 566 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 AL450023.3-201ENST00000440592 271 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 CEACAMP6-201ENST00000452007 574 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 AC025164.1-201ENST00000496249 478 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 AC027613.1-201ENST00000508414 457 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 ENPP7P9-201ENST00000514456 627 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 AP005059.1-201ENST00000578391 456 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 AL137078.2-201ENST00000615740 318 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 NBPF26-202ENST00000611287 2701 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 NBPF14-211ENST00000621070 2701 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 LINC00158-201ENST00000332587 1476 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 SAMMSON-210ENST00000641260 1308 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 DHX40P1-201ENST00000588725 1412 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 AL606516.1-201ENST00000455438 1861 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
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PTPRAP18433 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 AL391427.1-201ENST00000451575 425 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
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PTPRAP18433 SCARNA22-201ENST00000503991 125 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 WWC2-AS1-201ENST00000511846 404 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 MS4A7-208ENST00000530234 730 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
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PTPRAP18433 AL133371.2-201ENST00000556624 294 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
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PTPRAP18433 AC053481.3-201ENST00000577881 843 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 AL591926.2-202ENST00000615199 719 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 RMST_9.1-201ENST00000619945 193 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 MCMDC2-204ENST00000422365 5096 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 RBMS3-202ENST00000383766 2757 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 ELAVL2-202ENST00000380110 3691 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 IGSF10-201ENST00000282466 11067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 USP44-208ENST00000552440 1818 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 PDE4D-216ENST00000507116 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 SERPINB7-202ENST00000398019 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
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