Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 AL162591.2-201ENST00000449634 317 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 AC010235.1-201ENST00000450613 547 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 PLGLA-201ENST00000465668 449 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 RPL36AP41-201ENST00000493820 306 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 RNF138P1-201ENST00000502765 546 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 AC108475.1-201ENST00000507880 950 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 AL033397.2-201ENST00000508884 547 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 AP001992.1-204ENST00000525104 687 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 AC053481.3-201ENST00000577881 843 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 AC069061.3-201ENST00000582254 823 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 NFIB-211ENST00000606230 2311 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 CFAP70-203ENST00000355577 3691 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 OR6K3-201ENST00000368145 1844 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 KRTAP24-1-201ENST00000340345 1650 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 TPTE2-201ENST00000255310 1562 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 KCNJ6-201ENST00000609713 19645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 OR5M3-202ENST00000641993 1400 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 AC009237.5-201ENST00000414271 501 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 UQCRBP1-201ENST00000421129 336 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 LINC01074-201ENST00000422527 555 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 AL662791.1-201ENST00000441992 928 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 AC098484.1-201ENST00000447572 484 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 AC114755.5-201ENST00000447760 831 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 AC087312.1-201ENST00000471411 480 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 AC110792.2-201ENST00000510278 224 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 EGFLAM-AS2-201ENST00000512603 466 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 CARD16-203ENST00000525374 503 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 AP002993.1-201ENST00000538624 210 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 PSMA3-213ENST00000557508 814 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 AC008782.1-201ENST00000603386 430 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 AC011816.2-201ENST00000607089 556 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 DARS-AS1-230ENST00000631306 530 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 AC092017.3-201ENST00000638880 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 AL360270.1-201ENST00000440689 2359 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 ANAPC1P1-201ENST00000426186 2145 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 MYOT-202ENST00000421631 1474 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 OR56B2P-202ENST00000641377 2453 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 RPS4Y1-201ENST00000250784 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 EEF1A1P42-201ENST00000613436 1331 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 ACTR3BP2-202ENST00000623630 1338 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 SNORD96B-201ENST00000386148 79 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 PLCE1-AS2-201ENST00000419353 459 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.8 ms