Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 CNOT6LP1-201ENST00000559681 1462 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 EMB-205ENST00000514111 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 OR8H1-201ENST00000313022 1038 ntAPPRIS P2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 AC092638.1-201ENST00000411966 1275 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 MTND4P11-201ENST00000417020 1058 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 MTCO1P43-201ENST00000431831 488 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 RPL39L-202ENST00000433055 749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 A2ML1-AS1-201ENST00000537288 452 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 AL512283.1-201ENST00000606756 1384 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 CXADR-205ENST00000400169 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 IL6ST-204ENST00000381293 612 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 DHFRP5-201ENST00000406944 564 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 PRELID3BP11-201ENST00000414230 479 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 AC005351.1-201ENST00000511152 786 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 TTN-AS1-213ENST00000584485 838 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 OR2AS2P-201ENST00000606902 342 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 AL355816.1-201ENST00000607951 118 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 AL121594.5-201ENST00000631724 573 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 AC074099.1-201ENST00000634100 679 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 AC096656.1-201ENST00000623826 1364 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 CLEC4A-201ENST00000229332 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 METTL21EP-201ENST00000298105 713 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 RNU6-1251P-201ENST00000364502 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 KLRC2-201ENST00000381901 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 GLS-203ENST00000409215 632 ntTSL 4 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 LINC00457-201ENST00000428706 413 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 AC004994.1-201ENST00000447057 313 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 RNU7-27P-201ENST00000459281 62 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 AC112673.1-201ENST00000513168 575 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 ERP27-202ENST00000540097 993 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 AC016134.1-201ENST00000565259 701 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 AC025682.1-201ENST00000582389 437 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 AP001542.1-201ENST00000591314 200 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 IL21-202ENST00000611104 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 KLRC2-206ENST00000619500 883 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 RNF6P1-201ENST00000444889 1784 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 ELOCP6-201ENST00000429066 328 ntBASIC3.21□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC3.21□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 AC129850.1-201ENST00000436203 508 ntBASIC3.21□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 AC099677.4-201ENST00000446786 380 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC3.21□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 BIRC6-AS1-201ENST00000455572 697 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 OR7L1P-201ENST00000456181 380 ntBASIC3.21□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC3.21□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 ELOCP12-201ENST00000458706 328 ntBASIC3.21□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC3.21□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC3.21□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 ZFPM2-AS1-204ENST00000520433 748 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 AC025300.1-201ENST00000526616 384 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 AKAP7-208ENST00000537868 1006 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 TRAV11-201ENST00000539512 339 ntBASIC3.21□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 LINC02301-201ENST00000553760 773 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ZBED9Q6R2W3 CFLAR-AS1-201ENST00000415011 1072 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
ZBED9Q6R2W3 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ZBED9Q6R2W3 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ZBED9Q6R2W3 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ZBED9Q6R2W3 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ZBED9Q6R2W3 AC005208.1-201ENST00000435112 599 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ZBED9Q6R2W3 AL353898.1-201ENST00000444055 238 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ZBED9Q6R2W3 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107 ms