Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 5S_rRNA.28-201ENST00000638107 119 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 PDE4D-229ENST00000638939 375 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 ZNF177-202ENST00000589262 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
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PTPRNQ16849 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 AL357568.1-201ENST00000421530 1963 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
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PTPRNQ16849 IARS-213ENST00000627121 4587 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 VPS35-201ENST00000299138 6790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
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PTPRNQ16849 TMED10-201ENST00000303575 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
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PTPRNQ16849 STAG2-202ENST00000371144 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 TLR10-201ENST00000308973 3958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 ZNF436-201ENST00000314011 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 RAB30-214ENST00000534141 3746 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
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PTPRNQ16849 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
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PTPRNQ16849 STYX-202ENST00000442123 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
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PTPRNQ16849 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
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PTPRNQ16849 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
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PTPRNQ16849 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
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PTPRNQ16849 AC008945.1-201ENST00000505144 499 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 AC108210.1-201ENST00000510772 825 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 AC091180.4-201ENST00000511322 245 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 AC051619.2-201ENST00000559063 397 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 THSD4-AS1-201ENST00000561571 554 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
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