Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NRF1Q16656 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NRF1Q16656 RNU6-236P-201ENST00000363886 106 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NRF1Q16656 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NRF1Q16656 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NRF1Q16656 PLG-203ENST00000366924 1166 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
NRF1Q16656 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NRF1Q16656 RNU6-298P-201ENST00000390888 96 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NRF1Q16656 RPL7P27-201ENST00000403775 720 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NRF1Q16656 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NRF1Q16656 Z93403.1-201ENST00000411879 895 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
NRF1Q16656 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
NRF1Q16656 USP9YP21-201ENST00000420603 432 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NRF1Q16656 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NRF1Q16656 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NRF1Q16656 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
NRF1Q16656 OR2B8P-201ENST00000432841 938 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NRF1Q16656 ENOX1-AS2-201ENST00000434273 609 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
NRF1Q16656 AL445259.1-202ENST00000434768 379 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
NRF1Q16656 CLEC5A-202ENST00000438351 743 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
NRF1Q16656 AL035701.1-201ENST00000444038 462 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
NRF1Q16656 Z99714.1-201ENST00000450463 807 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NRF1Q16656 MGAT4A-209ENST00000495056 683 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
NRF1Q16656 AC010406.1-201ENST00000507948 555 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
NRF1Q16656 AC116616.1-201ENST00000508815 366 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
NRF1Q16656 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NRF1Q16656 snoZ278.1-201ENST00000517059 112 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NRF1Q16656 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
NRF1Q16656 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
NRF1Q16656 AC087242.1-201ENST00000536931 572 ntTSL 4 BASIC3.05□□□□□ -1.92
NRF1Q16656 UNC13C-202ENST00000539562 938 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
NRF1Q16656 AC073912.2-201ENST00000542821 317 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
NRF1Q16656 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
NRF1Q16656 AC087463.4-202ENST00000566676 579 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
NRF1Q16656 AC122134.1-202ENST00000569111 1201 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NRF1Q16656 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NRF1Q16656 MIR4666A-201ENST00000580160 79 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NRF1Q16656 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NRF1Q16656 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC3.05□□□□□ -1.92
NRF1Q16656 AF129408.1-201ENST00000608767 431 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NRF1Q16656 AL354976.1-201ENST00000613843 387 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NRF1Q16656 NEAT1-205ENST00000616315 483 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
NRF1Q16656 MIR4278-201ENST00000636094 69 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NRF1Q16656 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NRF1Q16656 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
NRF1Q16656 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
NRF1Q16656 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
NRF1Q16656 AC020637.1-201ENST00000546977 1447 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
NRF1Q16656 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NRF1Q16656 AC138915.3-201ENST00000562908 1389 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NRF1Q16656 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
NRF1Q16656 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NRF1Q16656 TAF9BP1-201ENST00000396646 746 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NRF1Q16656 AL669831.5-220ENST00000412115 581 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
NRF1Q16656 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
NRF1Q16656 BTF3P8-201ENST00000414577 526 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NRF1Q16656 RPS7P9-201ENST00000414704 586 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NRF1Q16656 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NRF1Q16656 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NRF1Q16656 AC233981.1-201ENST00000423224 461 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NRF1Q16656 Z97206.2-201ENST00000423489 589 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
NRF1Q16656 C1DP1-201ENST00000426049 402 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NRF1Q16656 LINC01953-201ENST00000426870 717 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
NRF1Q16656 MTCYBP32-201ENST00000427945 1084 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NRF1Q16656 ABCC13-201ENST00000429114 611 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
NRF1Q16656 PTGES3P1-201ENST00000439531 483 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NRF1Q16656 RNF2P1-201ENST00000442955 1010 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NRF1Q16656 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NRF1Q16656 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
NRF1Q16656 AC017015.1-201ENST00000477387 286 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NRF1Q16656 AC104982.1-201ENST00000478775 574 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NRF1Q16656 EPGN-204ENST00000502358 312 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
NRF1Q16656 EPGN-206ENST00000503098 339 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
NRF1Q16656 EPGN-207ENST00000505212 285 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
NRF1Q16656 AC113347.4-201ENST00000506032 685 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
NRF1Q16656 AC048346.1-201ENST00000510247 144 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NRF1Q16656 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NRF1Q16656 AC008837.1-201ENST00000511513 412 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NRF1Q16656 AC093248.1-201ENST00000513197 417 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
NRF1Q16656 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
NRF1Q16656 LINC02353-201ENST00000515181 849 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
NRF1Q16656 AC093535.1-201ENST00000515808 747 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
NRF1Q16656 PKIA-AS1-203ENST00000522807 692 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
NRF1Q16656 AC104417.1-201ENST00000523974 751 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NRF1Q16656 AP001207.1-201ENST00000524051 481 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NRF1Q16656 MTCYBP41-201ENST00000528913 1123 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NRF1Q16656 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NRF1Q16656 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
NRF1Q16656 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NRF1Q16656 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
NRF1Q16656 AC091691.2-201ENST00000581940 567 ntTSL 4 BASIC3.04□□□□□ -1.92
NRF1Q16656 AC022069.1-201ENST00000582910 658 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NRF1Q16656 AC006557.3-201ENST00000592926 517 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
NRF1Q16656 AL606834.3-201ENST00000602615 496 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NRF1Q16656 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NRF1Q16656 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NRF1Q16656 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
NRF1Q16656 AC004808.1-201ENST00000627671 721 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NRF1Q16656 LINC00836-203ENST00000628620 1179 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
NRF1Q16656 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.1 ms