Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 AC134980.1-208ENST00000640228 535 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 SLC25A46-208ENST00000513807 1546 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 CR383658.2-201ENST00000547576 1525 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 CD2-201ENST00000369477 478 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 RPL7P27-201ENST00000403775 720 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 AL139098.1-201ENST00000407291 389 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 AL669831.5-220ENST00000412115 581 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 EPGN-202ENST00000413830 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 AL158013.1-202ENST00000419666 520 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 MTCYBP24-201ENST00000420387 1106 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 AL031429.1-201ENST00000426775 749 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 GCA-203ENST00000429691 824 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 CASP12-207ENST00000447913 819 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 AC074327.1-201ENST00000448017 540 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 PDSS1P2-201ENST00000449397 678 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 AC244505.3-201ENST00000454598 187 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 LINC00973-201ENST00000473756 962 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 ZCCHC10-207ENST00000509437 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 LINC02283-201ENST00000511634 474 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 AC112206.4-201ENST00000515142 405 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 AC007876.1-201ENST00000527562 983 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 AL353699.1-201ENST00000529078 365 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 AL392023.2-202ENST00000555342 494 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 AC025272.1-201ENST00000569661 483 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 AC090330.1-201ENST00000588646 764 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 AC006116.7-201ENST00000590141 756 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 DNAJC19P3-201ENST00000594491 331 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 AP002802.2-201ENST00000605877 235 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 LINC01440-205ENST00000608080 737 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 AC124016.2-201ENST00000610058 665 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 AC098679.5-201ENST00000624394 571 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 RPS4Y2-201ENST00000629237 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 AC127502.3-201ENST00000636170 1206 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 MEG8-222ENST00000637332 1237 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 AC106858.1-201ENST00000637497 429 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 TANK-206ENST00000406287 875 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 HSFY4P-201ENST00000415994 1181 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 AC245052.5-201ENST00000416320 649 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 AC010967.1-201ENST00000421575 489 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 AC069157.1-201ENST00000421749 137 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 DPYD-AS2-201ENST00000422259 788 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 ZNF736P7Y-201ENST00000425158 820 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 AC092634.2-201ENST00000428146 1010 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 TRBV26OR9-2-201ENST00000432077 293 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 NDUFAF4P2-201ENST00000445374 520 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 AL672167.3-201ENST00000465951 960 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 GAPDHP39-201ENST00000481866 979 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 ZBTB20-AS3-201ENST00000498630 464 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 INPP4B-206ENST00000506217 673 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 AC111000.2-201ENST00000507775 550 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 AC097480.1-201ENST00000509416 712 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 RN7SKP157-201ENST00000516174 282 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 RNA5SP135-201ENST00000517019 125 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 snoZ278.1-201ENST00000517059 112 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.8 ms