Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 AL035078.3-201ENST00000525382 241 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 LSM3P2-201ENST00000551246 273 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 NOVA1-AS1-203ENST00000552101 468 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 AC006504.2-201ENST00000589471 458 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 AC112493.1-201ENST00000609836 303 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 C2orf27A-204ENST00000623058 969 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 AC019278.1-201ENST00000623516 479 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 AP000843.1-201ENST00000624880 701 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 LINC00706-201ENST00000628989 699 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 RAD51AP1-202ENST00000352618 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 AC107027.3-201ENST00000565095 3473 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 AC232271.1-201ENST00000602455 2715 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 SLC12A1-201ENST00000330289 1764 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 CUL4B-204ENST00000404115 3264 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 MRPS21P2-201ENST00000424704 264 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 AL162419.1-201ENST00000440674 873 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 RPL7L1P8-201ENST00000469911 741 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 SNRPCP3-201ENST00000474888 476 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 AC005798.1-201ENST00000513715 387 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 AC010261.2-201ENST00000515563 588 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 AC068672.1-201ENST00000520391 328 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 AC044839.1-205ENST00000614989 542 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 AL451142.2-201ENST00000429076 2090 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 POSTN-204ENST00000379749 3210 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 CYP4Z1-201ENST00000334194 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 LINC01277-201ENST00000419957 2398 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 SAMMSON-226ENST00000642089 1582 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 OR56A4-204ENST00000641835 3613 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 RNF145-206ENST00000519865 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 ZNF568-216ENST00000619231 3797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 MTUS1-203ENST00000381861 3996 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 ACKR4-201ENST00000249887 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 IL6-206ENST00000407492 926 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 RNA5SP345-201ENST00000410646 108 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CCDC85BQ15834 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.7 ms