Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 AC006386.1-201ENST00000619436 415 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 CNBD1-207ENST00000620844 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 AL512506.2-201ENST00000624472 458 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 AC090897.3-201ENST00000636973 1157 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 ZNF663P-202ENST00000641770 1131 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 ARF4-206ENST00000489843 1360 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 MTCO1P24-201ENST00000515438 1558 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AC117529.2-201ENST00000512159 2068 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 RNU4-28P-201ENST00000364739 141 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 SNORD116.1-201ENST00000365628 92 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 MLLT3-201ENST00000380321 708 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 BTBD10P2-201ENST00000404779 676 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 BOLA3P4-201ENST00000418151 400 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AL390774.2-201ENST00000423942 788 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AC005345.1-201ENST00000431868 217 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AC093155.1-201ENST00000440164 826 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AC010157.1-201ENST00000440589 527 ntTSL 4 BASIC2.96□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 Z73417.1-201ENST00000447373 778 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AC002383.1-201ENST00000448260 671 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 RFC5P1-201ENST00000454419 874 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AL445488.1-201ENST00000457272 706 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 PNPLA4P1-201ENST00000458328 305 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AC005410.1-202ENST00000460347 485 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 RPL5P24-201ENST00000463742 885 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AC069444.1-201ENST00000489428 266 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 RHOBTB3-204ENST00000504179 883 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AC112695.1-201ENST00000504213 592 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
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HERPUD1Q15011 AC087241.1-201ENST00000508615 429 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AC008700.1-201ENST00000512571 654 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AP000926.4-201ENST00000527351 454 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AL035078.2-201ENST00000533832 326 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 UNC13C-202ENST00000539562 938 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 OR6C73P-201ENST00000546432 358 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 LINC02294-201ENST00000549330 497 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC2.96□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AC090695.1-201ENST00000561269 1222 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 MTCYBP28-201ENST00000566728 1132 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AC107075.1-201ENST00000613695 314 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AC098679.5-201ENST00000624394 571 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 C8orf89-202ENST00000624510 658 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC2.96□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 PCF11-AS1-201ENST00000602322 1516 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 COX7B2-201ENST00000355591 542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 PTPRC-202ENST00000367364 1017 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
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HERPUD1Q15011 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 MIR513B-201ENST00000385136 84 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AL355379.1-201ENST00000405542 640 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AL133264.1-201ENST00000407157 562 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 RPS7P13-201ENST00000413955 498 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AC092634.6-201ENST00000418558 192 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
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