Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 AP001372.4-201ENST00000524889 472 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 MED28P5-201ENST00000528254 438 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 AC103843.2-201ENST00000530523 682 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 MYL12A-202ENST00000536605 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 RFPL1S-203ENST00000539579 330 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 EEF1B2P4-201ENST00000551398 348 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 AL160191.1-201ENST00000555480 566 ntTSL 4 BASIC3.87□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 AL512347.1-201ENST00000566420 503 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 MYL12A-209ENST00000580887 899 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 MIR4760-201ENST00000585040 80 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 AC080013.4-201ENST00000607624 649 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 AC007349.4-201ENST00000608114 532 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 AC106873.1-201ENST00000420664 459 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 AL139421.1-201ENST00000423010 169 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 AC009313.1-201ENST00000425470 503 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 AL031429.1-201ENST00000426775 749 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 DIAPH3-AS2-201ENST00000428656 367 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 RPL26P28-201ENST00000451325 435 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 AC020593.1-201ENST00000507399 299 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 LINC02201-201ENST00000508992 468 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 XKRY-201ENST00000510392 1100 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 AC108043.1-201ENST00000512696 574 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 FABP5P12-201ENST00000515543 389 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 AC116535.2-201ENST00000532365 441 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 AC092851.1-201ENST00000535964 478 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
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ALCAMQ13740 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 AL133370.1-201ENST00000554679 537 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 AC009704.1-201ENST00000583702 331 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 VN1R79P-201ENST00000593540 513 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 AC008946.1-201ENST00000599756 421 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 AC055876.5-201ENST00000605667 259 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 C8orf89-201ENST00000613105 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 MIR4278-201ENST00000636094 69 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 AC106871.1-201ENST00000568324 3102 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 MCF2-210ENST00000536274 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC3.86□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 TAF7L-201ENST00000324762 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 SNORA51.2-201ENST00000364595 132 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 SNX10-203ENST00000409367 746 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 AL158834.2-201ENST00000415731 696 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 RPS7P15-201ENST00000415804 584 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 RPL7P53-201ENST00000421245 739 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 AL929288.1-201ENST00000426262 746 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 AC122718.1-201ENST00000439448 744 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ALCAMQ13740 TIPARP-AS1-201ENST00000463449 735 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
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