Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 AC026116.1-201ENST00000551729 474 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 AC079070.1-201ENST00000578740 555 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 AC090844.2-203ENST00000582263 632 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 AL451044.1-201ENST00000604867 238 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 ARF4P1-201ENST00000605447 541 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 AC008121.2-201ENST00000614647 523 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 AC013727.1-201ENST00000618581 839 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 ZRANB2-AS2-221ENST00000624050 629 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 CDK14-201ENST00000265741 4953 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 ZNF808-201ENST00000359798 3600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 SCEL-201ENST00000349847 2386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 AC046195.1-201ENST00000518973 4171 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 AC110760.2-201ENST00000508031 2546 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 ARHGAP42-201ENST00000298815 4752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 ABI3BP-206ENST00000471714 6783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 SMC6-203ENST00000402989 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 RN7SKP167-201ENST00000411047 285 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 TMSB10P2-201ENST00000416049 131 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 RPS12P23-201ENST00000419579 400 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 AL929288.1-201ENST00000426262 746 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 AC011998.1-201ENST00000433403 117 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 AC078993.1-203ENST00000435789 1037 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 HLA-N-201ENST00000437516 135 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 AL162384.1-201ENST00000437881 499 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 AC091862.1-201ENST00000438016 1100 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 AC099563.1-201ENST00000456086 418 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 AC027613.1-201ENST00000508414 457 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 TMEM248P1-201ENST00000510579 951 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 LRRTM2-203ENST00000521094 1182 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 OR4R3P-201ENST00000525084 838 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 OR5M7P-201ENST00000526140 972 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 MFAP5-205ENST00000535336 566 ntTSL 4 BASIC4.25□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 UNC13C-202ENST00000539562 938 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 EEF1B2P4-201ENST00000551398 348 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 AC004160.1-202ENST00000599917 578 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 AC025946.2-201ENST00000603398 234 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 AL139089.1-201ENST00000620372 975 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 OR52E4-202ENST00000641726 2947 ntAPPRIS P1 BASIC4.25□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 NCOA1-203ENST00000395856 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 AC007390.2-201ENST00000606229 3803 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.24□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 DPPA3-201ENST00000345088 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 AIMP1P1-201ENST00000418670 937 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 LINC01341-201ENST00000419361 552 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 RPL17P36-201ENST00000420302 549 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 MTND1P34-201ENST00000438556 671 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
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