Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 TMEM161B-AS1-208ENST00000507736 630 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
ATRQ13535 AC021146.1-201ENST00000511202 716 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ATRQ13535 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ATRQ13535 ATP13A5-205ENST00000620313 709 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
ATRQ13535 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
ATRQ13535 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
ATRQ13535 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
ATRQ13535 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
ATRQ13535 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
ATRQ13535 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
ATRQ13535 CFHR4-203ENST00000367418 1066 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
ATRQ13535 AL121834.1-202ENST00000404494 277 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ATRQ13535 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
ATRQ13535 PTP4A1P7-201ENST00000423476 514 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ATRQ13535 AP000936.3-201ENST00000438127 255 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ATRQ13535 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ATRQ13535 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ATRQ13535 AC022882.1-201ENST00000532142 501 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ATRQ13535 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
ATRQ13535 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
ATRQ13535 CR589904.2-201ENST00000612533 440 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ATRQ13535 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
ATRQ13535 MTND5P3-201ENST00000438536 1800 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ATRQ13535 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ATRQ13535 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
ATRQ13535 KLRC2-201ENST00000381901 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
ATRQ13535 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ATRQ13535 AL365396.1-201ENST00000430854 671 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ATRQ13535 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ATRQ13535 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ATRQ13535 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ATRQ13535 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
ATRQ13535 KLRC2-206ENST00000619500 883 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
ATRQ13535 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
ATRQ13535 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC1.86□□□□□ -2.11
ATRQ13535 NUDCD1-202ENST00000427660 2098 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
ATRQ13535 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ATRQ13535 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
ATRQ13535 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ATRQ13535 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ATRQ13535 SUMO1-205ENST00000409205 534 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
ATRQ13535 SETP10-201ENST00000424368 814 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ATRQ13535 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ATRQ13535 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
ATRQ13535 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
ATRQ13535 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ATRQ13535 MIR7973-1-201ENST00000614683 76 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ATRQ13535 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ATRQ13535 AC138915.3-201ENST00000562908 1389 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ATRQ13535 SLCO1B1-201ENST00000256958 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
ATRQ13535 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
ATRQ13535 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
ATRQ13535 IL1RAPL2-201ENST00000344799 1290 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
ATRQ13535 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ATRQ13535 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
ATRQ13535 KLRC2-202ENST00000381902 1221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
ATRQ13535 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ATRQ13535 AC009237.2-201ENST00000421358 284 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ATRQ13535 FO393414.1-201ENST00000428697 1184 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ATRQ13535 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ATRQ13535 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ATRQ13535 AC104090.1-201ENST00000506341 1171 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ATRQ13535 AC008728.1-201ENST00000512730 691 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
ATRQ13535 AC090281.1-201ENST00000523019 276 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ATRQ13535 AL606537.1-201ENST00000607258 2011 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ATRQ13535 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
ATRQ13535 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
ATRQ13535 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
ATRQ13535 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ATRQ13535 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ATRQ13535 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ATRQ13535 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ATRQ13535 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ATRQ13535 AC093772.1-201ENST00000513519 506 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
ATRQ13535 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ATRQ13535 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
ATRQ13535 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ATRQ13535 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
ATRQ13535 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ATRQ13535 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ATRQ13535 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
ATRQ13535 KLRC1-202ENST00000359151 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
ATRQ13535 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
ATRQ13535 YWHAZ-219ENST00000522542 1394 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
ATRQ13535 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ATRQ13535 GCNT6-201ENST00000379591 934 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ATRQ13535 IQCA1-AS1-201ENST00000413353 489 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
ATRQ13535 MLIP-IT1-201ENST00000441845 643 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
ATRQ13535 AL121877.1-201ENST00000453704 622 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ATRQ13535 RPS6P2-201ENST00000454208 705 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ATRQ13535 AC016687.1-201ENST00000482574 353 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ATRQ13535 RPS26P24-201ENST00000497656 331 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ATRQ13535 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC1.84□□□□□ -2.11
ATRQ13535 RNU6ATAC39P-201ENST00000516309 149 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ATRQ13535 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
ATRQ13535 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
ATRQ13535 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ATRQ13535 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ATRQ13535 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
ATRQ13535 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.12
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