Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 MTCO3P16-201ENST00000454456 754 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 AC021146.1-201ENST00000511202 716 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC4.01□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 AL049838.1-201ENST00000563647 981 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 BNIP3P40-201ENST00000596017 556 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 AC128687.1-201ENST00000605304 619 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 OR8H2-202ENST00000618136 1038 ntAPPRIS ALT1 BASIC4.01□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 MIR1322-201ENST00000638013 71 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 C1orf189-201ENST00000368525 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 RNU6-1242P-201ENST00000391052 103 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 RNU6-584P-201ENST00000410350 95 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 USP9YP24-201ENST00000434374 697 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 SKP1P1-201ENST00000438081 489 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 USP9YP17-201ENST00000444617 696 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 AC099563.1-201ENST00000456086 418 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 DUXAP8-207ENST00000456786 622 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 ACTG1P13-201ENST00000486987 1043 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 GTF2IP9-201ENST00000502460 301 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 TPT1P8-201ENST00000510120 555 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 AC026412.2-201ENST00000512270 1075 ntBASIC4□□□□□ -1.77
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PRPF4BQ13523 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
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PRPF4BQ13523 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC4□□□□□ -1.77
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PRPF4BQ13523 AL032819.1-201ENST00000568554 379 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
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PRPF4BQ13523 DUXAP10-204ENST00000612052 616 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 AC107075.1-201ENST00000613695 314 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 OR5H6-201ENST00000615035 1113 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 ABCC9-206ENST00000621589 450 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 RPS4Y2-201ENST00000629237 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 AC244205.2-202ENST00000635781 342 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 OR5H6-202ENST00000641416 1032 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 ZNF542P-204ENST00000482727 1305 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 TAF7L-201ENST00000324762 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 AC127526.1-201ENST00000417526 366 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 GLRXP1-201ENST00000423261 334 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
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PRPF4BQ13523 AL390783.1-203ENST00000457058 248 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 LINC00973-201ENST00000473756 962 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 LNX1-AS2-201ENST00000502410 347 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 MTCYBP17-201ENST00000503579 789 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
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