Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 RNU1-95P-201ENST00000516357 160 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 AC084757.1-201ENST00000559987 490 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 DSCR9-205ENST00000585273 751 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 AC015813.4-201ENST00000610469 179 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 MIR7702-201ENST00000621931 59 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 AP004289.2-201ENST00000444413 1457 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 MIR448-201ENST00000362131 111 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 PTPRC-202ENST00000367364 1017 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 Z85994.1-201ENST00000406912 606 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 PGBD4P8-201ENST00000412993 562 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 TTTY12-201ENST00000413466 979 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 RPL23AP89-201ENST00000439324 255 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 AL357520.1-201ENST00000441557 453 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 PDSS1P2-201ENST00000449397 678 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 LINC00456-201ENST00000453862 692 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 AC093853.1-201ENST00000515689 483 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 RNA5SP179-201ENST00000517284 121 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 AC073651.3-201ENST00000545999 417 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 CCNG2P1-201ENST00000549521 1000 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 AL355773.1-201ENST00000554458 459 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 AC099313.1-201ENST00000568437 452 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 MTND6P33-201ENST00000571794 183 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 AC090312.1-201ENST00000580637 348 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 AC012417.1-201ENST00000582307 1039 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
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BFSP2Q13515 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 AC025588.4-201ENST00000615802 908 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 MESTIT1_2.1-201ENST00000616328 235 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 CT45A10-202ENST00000617981 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 MIR7154-201ENST00000620673 73 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 CT45A7-202ENST00000620885 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 SATB1-AS1-269ENST00000630766 591 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 OR9H1P-201ENST00000446393 4888 ntAPPRIS P1 BASIC4.41□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 NOL8P1-201ENST00000508336 3529 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 LRRC63-203ENST00000595396 2327 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 KLRC1-201ENST00000347831 1332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 SUPT16HP1-201ENST00000537175 3133 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 ASNSP1-201ENST00000518311 1939 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 C2orf16-202ENST00000447166 16401 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 RANBP6-201ENST00000259569 4576 ntAPPRIS P1 BASIC4.4□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
BFSP2Q13515 OR4F6-201ENST00000328882 1238 ntAPPRIS P1 BASIC4.4□□□□□ -1.71
BFSP2Q13515 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
BFSP2Q13515 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
BFSP2Q13515 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
BFSP2Q13515 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
BFSP2Q13515 RPS7P13-201ENST00000413955 498 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
BFSP2Q13515 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
BFSP2Q13515 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
BFSP2Q13515 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
BFSP2Q13515 Z97055.1-201ENST00000419730 712 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
BFSP2Q13515 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
BFSP2Q13515 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
BFSP2Q13515 LINC01825-201ENST00000452381 850 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
BFSP2Q13515 HMGB3P21-201ENST00000452483 547 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
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