Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 CGA-204ENST00000627148 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 AC103706.2-201ENST00000638080 240 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 PLCL2-202ENST00000432376 3940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 AC024940.1-203ENST00000398963 4423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 DNAJC10-201ENST00000264065 20129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 NKTR-219ENST00000617821 7319 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 OR6A2-202ENST00000641196 4295 ntAPPRIS P1 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 MGA-202ENST00000545763 11413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 FBXO8-205ENST00000615392 1591 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 OR10J1-203ENST00000642080 3503 ntAPPRIS P1 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 HEATR5B-201ENST00000233099 6905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 HSPE1P12-201ENST00000412576 301 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 TTC3-AS1-201ENST00000424733 1097 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 OR5BE1P-201ENST00000425977 939 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 AL138759.1-201ENST00000432120 645 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 LINC00354-202ENST00000440860 376 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 AC009299.3-202ENST00000445372 538 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 AC010976.1-211ENST00000454503 644 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 AC084117.1-201ENST00000496975 270 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 MIR2114-201ENST00000516645 80 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 AC079209.2-201ENST00000519107 431 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 IFITM8P-201ENST00000522529 394 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 UBTFL10-201ENST00000528532 562 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 AC073525.1-202ENST00000550049 732 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 AC107016.1-201ENST00000550463 337 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 AC020891.1-201ENST00000558785 174 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 AC129492.2-201ENST00000577807 517 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 AC007952.9-201ENST00000584365 191 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 MIR7515HG-243ENST00000591400 1067 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 AC020914.6-201ENST00000594327 272 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 AL163642.2-201ENST00000604722 1019 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 AC092354.2-201ENST00000607786 514 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 MIR7154-201ENST00000620673 73 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 AC103858.2-201ENST00000621471 543 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 AC007490.1-201ENST00000624321 703 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 OR5BE1P-202ENST00000641168 1176 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 FAM169A-201ENST00000389156 5990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 ZNF542P-204ENST00000482727 1305 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 AC116667.1-201ENST00000604855 2072 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 ZNF382-203ENST00000435416 3865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 PREPL-206ENST00000409936 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 AL672296.1-201ENST00000427780 2158 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 KCNJ16-201ENST00000283936 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 AC067945.1-201ENST00000342609 618 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 TCEAL7-202ENST00000372666 852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 MTND4P13-201ENST00000402078 1023 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 AL590704.1-201ENST00000402856 794 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 GCG-202ENST00000418842 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 AL590103.1-201ENST00000434488 307 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 MTCYBP34-201ENST00000439552 670 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 RPS4XP4-201ENST00000443195 763 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 AC018731.1-201ENST00000447078 576 ntTSL 4 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 ANP32BP2-201ENST00000454525 545 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 RPL7P9-201ENST00000468715 747 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CHAF1BQ13112 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.7 ms