Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 RN7SKP235-201ENST00000410662 305 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 AC010132.1-201ENST00000433315 561 ntTSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
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PTPRAP18433 AL445644.1-201ENST00000436524 751 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 DHFRP3-201ENST00000455595 559 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 ZNF273-204ENST00000476120 2000 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 RN7SL441P-201ENST00000492388 296 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 AC018797.3-201ENST00000513388 1241 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 AC018552.3-201ENST00000567416 561 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 AC106729.1-201ENST00000567777 466 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 MAPKAPK5-AS1-205ENST00000590479 543 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
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PTPRAP18433 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
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PTPRAP18433 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 AC243654.2-201ENST00000612843 443 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
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PTPRAP18433 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 CR392039.4-201ENST00000624968 501 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRAP18433 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
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PTPRAP18433 LINC01981-201ENST00000432163 2833 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
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PTPRAP18433 FRYL-209ENST00000506685 1940 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
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PTPRAP18433 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
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PTPRAP18433 DTNA-227ENST00000597599 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
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