Protein–RNA interactions for Protein: O00287

RFXAP, Regulatory factor X-associated protein, humanhuman

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAPO00287 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 OR8D1-201ENST00000357821 1026 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 AC068483.1-201ENST00000413403 660 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 LINC01690-201ENST00000424837 576 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 NANOGP6-201ENST00000429190 847 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 AC092809.1-201ENST00000441469 474 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 PHBP16-201ENST00000446318 950 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 AC004980.3-201ENST00000447046 365 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 AL355592.1-201ENST00000450292 386 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 AC011377.1-201ENST00000517708 275 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 AC009597.1-201ENST00000521215 584 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 LINC02390-201ENST00000541404 560 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 AC007406.1-201ENST00000544067 315 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 AC009852.2-201ENST00000567898 485 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 AC090844.2-203ENST00000582263 632 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 AC113194.1-201ENST00000606037 500 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 AC243773.3-201ENST00000613270 256 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 LRRC2-AS1-202ENST00000614743 633 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 MIR548A1HG-201ENST00000636739 558 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 AP000756.2-201ENST00000624168 2567 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 FCHSD2-205ENST00000409853 1867 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 ACTR3BP2-202ENST00000623630 1338 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 RNU1-94P-201ENST00000362627 173 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 AL590999.1-204ENST00000430595 638 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 RPS29P17-201ENST00000430795 166 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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RFXAPO00287 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 AC126178.1-201ENST00000548722 926 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 AC009803.2-201ENST00000550378 665 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 HMGN2P47-201ENST00000559378 272 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 AC009117.3-202ENST00000563825 557 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 AP005059.1-201ENST00000578391 456 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 MIR6133-201ENST00000617057 108 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 AC245452.5-201ENST00000620649 780 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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