Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 TTN-AS1-222ENST00000587576 399 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 CEACAM7-204ENST00000602225 524 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 AL391422.2-201ENST00000602854 361 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 RNF138P2-201ENST00000603490 592 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 MLECP1-201ENST00000615893 709 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 AC116563.2-201ENST00000624751 535 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 KIAA0586-202ENST00000354386 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 RPS4Y1-201ENST00000250784 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 AC025031.4-201ENST00000621248 3271 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 MTRNR2L6-201ENST00000604952 1447 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 AC064875.1-201ENST00000425974 1942 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
SH3BP1Q9Y3L3 AL512646.1-201ENST00000269395 1077 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 OR5AN1-201ENST00000313940 1037 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 HYKK-202ENST00000408962 847 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 EIF1AX-AS1-201ENST00000424026 378 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 AL139230.1-201ENST00000440094 425 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 TTTY22-201ENST00000445253 427 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 H2AFZP5-201ENST00000446960 382 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 AC104651.2-201ENST00000447549 528 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 SAMSN1-AS1-201ENST00000449214 840 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 AC107072.2-201ENST00000452412 555 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 APOA2-207ENST00000470459 416 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SL860P-201ENST00000473738 223 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01181-201ENST00000503718 556 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 AC025674.1-201ENST00000507074 324 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 ADGRL3-AS1-204ENST00000509461 481 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 AC011396.2-202ENST00000511390 375 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 AC026412.2-201ENST00000512270 1075 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 AC107463.1-202ENST00000514526 689 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 AC008562.1-201ENST00000521763 330 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 AC002428.2-201ENST00000522973 414 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 PTH-202ENST00000529816 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02386-201ENST00000551202 509 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 HYKK-203ENST00000563233 734 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 AC106745.1-201ENST00000566798 464 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 AC209154.1-201ENST00000582156 337 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 AC005255.1-201ENST00000593748 216 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 BNIP3P23-201ENST00000599655 511 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 PACRG-211ENST00000621363 360 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 OR5T1-201ENST00000641368 1118 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 MTUS1-216ENST00000519263 4089 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 C2orf16-202ENST00000447166 16401 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 THEMIS-205ENST00000626040 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF733P-201ENST00000331425 1506 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00276-201ENST00000417751 596 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.2 ms