Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ZBED9Q6R2W3 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ZBED9Q6R2W3 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ZBED9Q6R2W3 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ZBED9Q6R2W3 LINC01085-201ENST00000502759 1984 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ZBED9Q6R2W3 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ZBED9Q6R2W3 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ZBED9Q6R2W3 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ZBED9Q6R2W3 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 AL158825.1-201ENST00000414735 521 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 AC010745.4-201ENST00000420130 740 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 AC004594.1-217ENST00000422260 325 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 CYP3A43-210ENST00000444905 733 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 AC087071.2-201ENST00000483283 575 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 PRR16-204ENST00000505123 1298 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 AC010425.1-201ENST00000511734 554 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 RNU6-319P-201ENST00000516025 108 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 GCSAML-207ENST00000527541 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 OR4U1P-201ENST00000554958 912 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 AC010735.1-201ENST00000567305 1026 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 AC138473.1-201ENST00000605717 526 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 AC231759.1-201ENST00000616455 597 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 AC116563.2-201ENST00000624751 535 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 CCNB2P1-201ENST00000399411 1150 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 LINC00427-201ENST00000412722 430 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 AC023128.2-201ENST00000420880 1223 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 RPS15AP1-201ENST00000457423 391 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 AC091826.2-201ENST00000504034 412 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 LINC01088-203ENST00000507476 785 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 AC109466.1-214ENST00000522762 583 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 ZFPM2-AS1-207ENST00000524045 987 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 AC012409.1-202ENST00000558449 639 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 AC061975.8-201ENST00000587058 721 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 AC008894.1-201ENST00000587693 367 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 DAOA-AS1_2.2-201ENST00000610818 204 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 AC119674.1-212ENST00000641155 993 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 AL391832.1-201ENST00000423963 423 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 MTCYBP29-201ENST00000436327 1006 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 MTATP6P22-201ENST00000507369 598 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 AC239860.2-201ENST00000525886 270 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 TAS2R43-201ENST00000531678 1027 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 ZFAND6-208ENST00000558688 780 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 AP003117.2-201ENST00000606010 545 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZBED9Q6R2W3 AP003485.2-201ENST00000623636 610 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
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