Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 AC016687.2-203ENST00000506650 578 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 LINC02283-201ENST00000511634 474 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AC008780.1-201ENST00000513392 409 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 SNORA19.3-201ENST00000516165 130 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AP001317.1-201ENST00000531194 960 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 LINC02399-201ENST00000547094 400 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 TIMM9-203ENST00000555061 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 MTCYBP27-201ENST00000555160 670 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AC114546.1-201ENST00000560140 473 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AC025917.1-201ENST00000562062 612 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 LINC2194-201ENST00000567127 454 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 GOLGA8M-203ENST00000568033 557 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AC134669.2-201ENST00000578584 1008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AC217774.1-201ENST00000578936 517 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 MIR5708-201ENST00000579723 85 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AL139022.2-201ENST00000606934 443 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AL513477.2-201ENST00000607858 568 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 DAOA-AS1_2.2-201ENST00000610818 204 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AL392088.2-201ENST00000637607 285 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AL445984.1-201ENST00000637834 659 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 RNU4-51P-201ENST00000364206 140 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 FAM24A-201ENST00000368894 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 RNU6-224P-201ENST00000384055 107 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 MIR122-201ENST00000385044 85 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 RPL7P60-201ENST00000397636 735 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AL138880.1-201ENST00000405824 642 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AL354692.1-201ENST00000423044 315 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AC023469.2-201ENST00000425983 657 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 DPRXP1-201ENST00000426312 460 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AL161640.1-201ENST00000429507 390 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 RPL23AP16-201ENST00000441715 421 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 TIPARP-AS1-201ENST00000463449 735 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AC121764.2-201ENST00000469806 587 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 SUB1-203ENST00000502897 562 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 SCOC-206ENST00000506322 687 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 MTCYBP37-201ENST00000510642 1133 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AC011405.1-201ENST00000514207 248 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 RN7SKP13-201ENST00000515933 244 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 RRAS2-205ENST00000529237 1278 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AC091588.1-201ENST00000578504 359 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AC096947.1-201ENST00000603233 470 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AL391834.2-201ENST00000609982 546 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AC084824.4-201ENST00000620106 731 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AC079684.1-201ENST00000621405 437 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 MEG8-222ENST00000637332 1237 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 NCOA1-203ENST00000395856 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 SOD2P1-201ENST00000396543 562 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 Z85994.1-201ENST00000406912 606 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AC092634.6-201ENST00000418558 192 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 RPF2P1-201ENST00000424137 906 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms