Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
ZFHX3Q15911 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
ZFHX3Q15911 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ZFHX3Q15911 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC2.2□□□□□ -2.06
ZFHX3Q15911 SEC63P1-201ENST00000425785 1258 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ZFHX3Q15911 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ZFHX3Q15911 MTCO1P52-201ENST00000433928 531 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ZFHX3Q15911 AC092013.1-201ENST00000438795 332 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ZFHX3Q15911 CFTRP1-201ENST00000456646 183 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ZFHX3Q15911 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
ZFHX3Q15911 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ZFHX3Q15911 AC022069.1-201ENST00000582910 658 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ZFHX3Q15911 AL365503.1-201ENST00000605247 905 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ZFHX3Q15911 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
ZFHX3Q15911 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ZFHX3Q15911 AC106730.3-201ENST00000624568 641 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ZFHX3Q15911 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
ZFHX3Q15911 AC012170.1-201ENST00000495139 359 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZFHX3Q15911 AC021146.5-201ENST00000503544 545 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZFHX3Q15911 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZFHX3Q15911 OR5AK3P-201ENST00000527486 1297 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZFHX3Q15911 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
ZFHX3Q15911 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZFHX3Q15911 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
ZFHX3Q15911 CCDC14-217ENST00000485727 7917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
ZFHX3Q15911 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
ZFHX3Q15911 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
ZFHX3Q15911 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC2.19□□□□□ -2.06
ZFHX3Q15911 DEFB128-201ENST00000334391 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
ZFHX3Q15911 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
ZFHX3Q15911 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
ZFHX3Q15911 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZFHX3Q15911 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZFHX3Q15911 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZFHX3Q15911 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZFHX3Q15911 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZFHX3Q15911 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZFHX3Q15911 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZFHX3Q15911 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZFHX3Q15911 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZFHX3Q15911 LTV1P1-201ENST00000510683 1237 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZFHX3Q15911 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZFHX3Q15911 AC067817.1-201ENST00000518535 356 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
ZFHX3Q15911 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
ZFHX3Q15911 AC007688.2-201ENST00000545158 369 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
ZFHX3Q15911 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
ZFHX3Q15911 GTF2H2B-203ENST00000508065 1432 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZFHX3Q15911 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
ZFHX3Q15911 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ZFHX3Q15911 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ZFHX3Q15911 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.18□□□□□ -2.06
ZFHX3Q15911 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
ZFHX3Q15911 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ZFHX3Q15911 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ZFHX3Q15911 MEI4-201ENST00000602452 4800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
ZFHX3Q15911 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ZFHX3Q15911 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
ZFHX3Q15911 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ZFHX3Q15911 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ZFHX3Q15911 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ZFHX3Q15911 AC026167.1-201ENST00000435651 299 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
ZFHX3Q15911 AC093663.2-201ENST00000484625 313 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ZFHX3Q15911 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ZFHX3Q15911 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ZFHX3Q15911 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ZFHX3Q15911 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ZFHX3Q15911 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
ZFHX3Q15911 OR51F1-202ENST00000624103 939 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
ZFHX3Q15911 RN7SKP285-201ENST00000410137 318 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ZFHX3Q15911 CYP3A43-205ENST00000415413 990 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
ZFHX3Q15911 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ZFHX3Q15911 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ZFHX3Q15911 RPL23AP4-201ENST00000427757 463 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ZFHX3Q15911 RPS26P30-201ENST00000443431 335 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ZFHX3Q15911 AC007179.2-204ENST00000444001 765 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
ZFHX3Q15911 CYP3A43-210ENST00000444905 733 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
ZFHX3Q15911 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
ZFHX3Q15911 RPL21P134-201ENST00000453468 483 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ZFHX3Q15911 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ZFHX3Q15911 AC073912.2-201ENST00000542821 317 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
ZFHX3Q15911 AC008083.2-201ENST00000546707 476 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ZFHX3Q15911 AC010928.3-201ENST00000587712 541 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ZFHX3Q15911 AC116447.1-201ENST00000613153 453 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ZFHX3Q15911 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
ZFHX3Q15911 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
ZFHX3Q15911 ZNF542P-204ENST00000482727 1305 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ZFHX3Q15911 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ZFHX3Q15911 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ZFHX3Q15911 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
ZFHX3Q15911 AC074029.1-201ENST00000552531 1044 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ZFHX3Q15911 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.17□□□□□ -2.06
ZFHX3Q15911 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
ZFHX3Q15911 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
ZFHX3Q15911 GCSAML-206ENST00000527084 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
ZFHX3Q15911 CLEC4A-201ENST00000229332 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
ZFHX3Q15911 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ZFHX3Q15911 AC092598.1-201ENST00000431708 797 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
ZFHX3Q15911 AC012355.1-201ENST00000450290 769 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
ZFHX3Q15911 TMEM248P1-201ENST00000510579 951 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ZFHX3Q15911 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
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