Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRKQ15262 AC061975.8-201ENST00000587058 721 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRKQ15262 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRKQ15262 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRKQ15262 IFI16-201ENST00000295809 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRKQ15262 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRKQ15262 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRKQ15262 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRKQ15262 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRKQ15262 CLECL1-201ENST00000327839 670 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRKQ15262 UQCRFS1P3-201ENST00000407697 385 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRKQ15262 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRKQ15262 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRKQ15262 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRKQ15262 AL353597.2-202ENST00000434901 373 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRKQ15262 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRKQ15262 AC010157.1-201ENST00000440589 527 ntTSL 4 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRKQ15262 OR6C72P-201ENST00000451403 892 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRKQ15262 AL354710.1-201ENST00000453641 246 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRKQ15262 AC069277.2-201ENST00000454211 432 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRKQ15262 MTND4P2-201ENST00000507767 1203 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
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PTPRKQ15262 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRKQ15262 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRKQ15262 AC022884.3-201ENST00000579571 248 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRKQ15262 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRKQ15262 AC006116.7-201ENST00000590141 756 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRKQ15262 AC007620.3-201ENST00000608131 497 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRKQ15262 AC019131.2-201ENST00000609071 870 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRKQ15262 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRKQ15262 OR5T1-201ENST00000641368 1118 ntAPPRIS P1 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRKQ15262 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRKQ15262 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRKQ15262 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
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PTPRKQ15262 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRKQ15262 KLRC2-201ENST00000381901 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRKQ15262 HSPD1P16-201ENST00000402302 394 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRKQ15262 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRKQ15262 AC048351.1-201ENST00000420064 602 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRKQ15262 AC099336.2-201ENST00000422457 254 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRKQ15262 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRKQ15262 AL357520.1-201ENST00000441557 453 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRKQ15262 SATB1-AS1-204ENST00000453361 726 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRKQ15262 VN1R17P-201ENST00000472048 1090 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRKQ15262 AC113398.2-201ENST00000507630 558 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRKQ15262 AC027419.2-201ENST00000518439 497 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRKQ15262 CA3-AS1-203ENST00000524052 430 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRKQ15262 CKS1BP1-201ENST00000555221 240 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
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PTPRKQ15262 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
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PTPRKQ15262 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRKQ15262 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
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PTPRKQ15262 ZKSCAN7P1-201ENST00000543668 673 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPRKQ15262 LINC02325-202ENST00000554260 567 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.83
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PTPRKQ15262 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
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PTPRKQ15262 CFHR1-201ENST00000320493 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
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PTPRKQ15262 CFHR4-203ENST00000367418 1066 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRKQ15262 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
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PTPRKQ15262 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRKQ15262 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRKQ15262 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRKQ15262 AL121882.1-201ENST00000422893 417 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRKQ15262 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRKQ15262 Z99127.2-201ENST00000441426 334 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRKQ15262 RPL21P71-201ENST00000465598 459 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
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PTPRKQ15262 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRKQ15262 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRKQ15262 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRKQ15262 ZNF630-AS1-201ENST00000614448 397 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRKQ15262 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRKQ15262 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
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