Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 SOD1P3-201ENST00000518682 454 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 DUXAP2-201ENST00000519198 589 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 AC013509.1-201ENST00000524269 339 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 AC084838.1-201ENST00000532973 312 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 AC009803.2-201ENST00000550378 665 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 LINC01255-206ENST00000591431 441 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 VN1R82P-201ENST00000601481 356 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 AC006539.2-201ENST00000601729 572 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 AC026422.1-201ENST00000623961 452 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 AC098679.5-201ENST00000624394 571 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 EMSY-210ENST00000529032 6848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 NPVF-201ENST00000222674 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 HMGN2P8-201ENST00000391458 268 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC4.2□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 AC116035.1-201ENST00000431057 517 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 B3GNT2P1-201ENST00000434960 952 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 MTCYBP34-201ENST00000439552 670 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 SATB1-AS1-204ENST00000453361 726 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 LINC00888-204ENST00000487386 421 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 SETP14-201ENST00000497538 873 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 EIF4E-208ENST00000505992 898 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 AC093689.1-201ENST00000514737 246 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 MTCO1P47-201ENST00000523889 1271 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 CCNG2P1-201ENST00000549521 1000 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 AC106796.1-201ENST00000577173 615 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 AP001180.3-201ENST00000582221 145 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 AC067852.4-201ENST00000590314 478 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 AC009220.3-201ENST00000604318 586 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 AL592221.1-201ENST00000605266 382 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 AC079684.1-201ENST00000621405 437 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 AC107081.3-201ENST00000612715 2034 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 MGA-211ENST00000570161 11859 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 GLIPR1L1-201ENST00000312442 1132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 RPL7P60-201ENST00000397636 735 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 AC127526.1-201ENST00000417526 366 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 AC008280.1-201ENST00000418851 412 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 AC090960.1-201ENST00000421072 306 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 LINC01923-201ENST00000443261 592 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 MTCYBP3-201ENST00000445588 1137 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 AC098824.1-201ENST00000453565 980 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 ADGRL3-AS1-204ENST00000509461 481 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 Vault.1-201ENST00000516474 102 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 AC006960.3-201ENST00000561845 705 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 AC022069.1-201ENST00000582910 658 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 AL358072.1-201ENST00000604156 575 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 AC091946.2-201ENST00000606105 291 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 VIS1.1-201ENST00000610517 203 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
NEDD9Q14511 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
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